129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2879 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2879  phosphatidylserine synthase  100 
 
 		 450 aa  925    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00243  phosphatidylserine synthase  61.4 
 
 		 446 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2714  phosphatidylserine synthase  61.73 
 
 		 446 aa  577  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129545  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002160  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  62.38 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2677  phosphatidylserine synthase  55.96 
 
 		 445 aa  532  1e-150  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2876  phosphatidylserine synthase  50.23 
 
 		 477 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1747  phosphatidylserine synthase  52.62 
 
 		 437 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0103936 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2031  phosphatidylserine synthase  51.25 
 
 		 437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2077  phosphatidylserine synthase  51.48 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0168965  hitchhiker  0.00000205749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2081  phosphatidylserine synthase  51.48 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0513318  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2268  phosphatidylserine synthase  51.48 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00479995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2085  phosphatidylserine synthase  50.67 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2385  phosphatidylserine synthase  51.48 
 
 		 437 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.837268  hitchhiker  0.000152839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2327  phosphatidylserine synthase  51.71 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0552397  normal  0.109579 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2390  phosphatidylserine synthase  50.34 
 
 		 437 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1935  phosphatidylserine synthase  50.34 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113804 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2041  phosphatidylserine synthase  50.34 
 
 		 437 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1921  phosphatidylserine synthase  50.34 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1988  phosphatidylserine synthase  50.57 
 
 		 437 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.575301  hitchhiker  0.0000800206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2288  phosphatidylserine synthase  50.68 
 
 		 437 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288478  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1779  phosphatidylserine synthase  51.56 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3338  phosphatidylserine synthase  48.61 
 
 		 451 aa  425  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0750704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3463  CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase  47.11 
 
 		 447 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3244  phosphatidylserine synthase  46.44 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1965  phosphatidylserine synthase  48.75 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1975  phosphatidylserine synthase  47.73 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00104781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3207  phosphatidylserine synthase  48.71 
 
 		 452 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.213485  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3466  phosphatidylserine synthase  48.71 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0880056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3344  phosphatidylserine synthase  48.71 
 
 		 451 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00469023  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3494  phosphatidylserine synthase  48.73 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3749  phosphatidylserine synthase  48.23 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.162012  normal  0.31457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02479  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1083  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.99 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0300  phosphatidylserine synthase  44 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2742  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.933118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2872  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02443  hypothetical protein  47.99 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1092  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0886852  normal  0.0107866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2738  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0459118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2951  phosphatidylserine synthase  47.75 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3822  phosphatidylserine synthase  47.75 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.130415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2864  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.708838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2868  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.829218  normal  0.90868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2846  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2762  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.250299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2980  phosphatidylserine synthase  47.99 
 
 		 451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0851  phosphatidylserine synthase  46.59 
 
 		 451 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.136306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0884  phosphatidylserine synthase  45.63 
 
 		 451 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3070  phosphatidylserine synthase  47.28 
 
 		 451 aa  401  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.917906  hitchhiker  0.00425653 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0926  phosphatidylserine synthase  45.27 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3664  phosphatidylserine synthase  44.19 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.25424 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0025  phosphatidylserine synthase  44.32 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2065  phosphatidylserine synthase  44.19 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.361576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2239  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2235  phosphatidylserine synthase  45.11 
 
 		 442 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.702334 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63914  phosphatidylglycerolphosphate synthase  24.66 
 
 		 543 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.677182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3867  phospholipase D/transphosphatidylase  24.54 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000209979  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02261  hypothetical protein similar to phosphatidylglycerophosphate synthase (Eurofung)  24.49 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04600  CDP-diacylglycerol-glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, putative  28.74 
 
 		 552 aa  60.1  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5030  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.14 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2839  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.52 
 
 		 478 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000138907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5046  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.97 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.560279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5439  cardiolipin synthetase domain protein  22.87 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.443747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5477  cardiolipin synthetase domain-containing protein  22.04 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5144  phospholipase D/transphosphatidylase  23.71 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5524  cardiolipin synthetase domain protein  22.87 
 
 		 397 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2123  cardiolipin synthetase domain-containing protein  31.34 
 
 		 394 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5195  cardiolipin synthetase domain-containing protein  21.76 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5591  cardiolipin synthetase domain-containing protein  21.76 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2482  phospholipase D/transphosphatidylase  30.71 
 
 		 482 aa  55.1  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.2332  normal  0.876517 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1860  cardiolipin synthetase  30.6 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3008  cardiolipin synthase 2  28.57 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2155  cardiolipin synthetase domain protein  30.6 
 
 		 394 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000221314  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3725  cardiolipin synthase 2  28.57 
 
 		 405 aa  53.9  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3264  cardiolipin synthetase domain protein  29.03 
 
 		 377 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.415257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5469  cardiolipin synthetase domain protein  25.45 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000646533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5483  cardiolipin synthetase  25.72 
 
 		 371 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  hitchhiker  6.83583e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2125  phospholipase D/transphosphatidylase  22.8 
 
 		 494 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000100004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2163  phospholipase D/transphosphatidylase  22.8 
 
 		 494 aa  51.6  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.44679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2045  cardiolipin synthetase domain protein  28.39 
 
 		 377 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1870  cardiolipin synthetase  23.77 
 
 		 377 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0003289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2087  cardiolipin synthetase domain protein  23.5 
 
 		 394 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1907  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.5 
 
 		 378 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2054  cardiolipin synthetase domain-containing protein  23.5 
 
 		 367 aa  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900063  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47576  predicted protein  26.56 
 
 		 574 aa  50.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.124789  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3346  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.59 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000729556  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5588  putative phospholipase D/transphosphatidylase  27.97 
 
 		 534 aa  48.9  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2125  phospholipase D/Transphosphatidylase  22.55 
 
 		 477 aa  48.9  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.415387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  23.31 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2646  cardiolipin synthase 2  29.32 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.398806  normal  0.323758 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  27.65 
 
 		 478 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0638  phospholipase D/Transphosphatidylase  23.12 
 
 		 472 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1695  cardiolipin synthetase  22.16 
 
 		 488 aa  47.8  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3503  cardiolipin synthetase 2  30.08 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.918804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3596  phospholipase D/Transphosphatidylase  20.66 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0946  phospholipase D/transphosphatidylase  25.5 
 
 		 481 aa  47.8  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2360  phospholipase D/Transphosphatidylase  21.32 
 
 		 472 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.584228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3277  cardiolipin synthase 2  28.03 
 
 		 416 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.050833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0308  cardiolipin synthetase 2  19.59 
 
 		 477 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.267368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1934  cardiolipin synthetase  26.71 
 
 		 484 aa  47  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.560683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>