More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05381 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05381  transcriptional dual regulator NarL  100 
 
 		 204 aa  411  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000509  nitrate/nitrite response regulator protein  94.12 
 
 		 210 aa  368  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0613  nitrate/nitrite response regulator NarP  74.26 
 
 		 208 aa  287  8e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2370  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  66.67 
 
 		 203 aa  260  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3490  two component LuxR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0559776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2794  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  58.08 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0858473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1384  two component LuxR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1270  nitrate/nitrite response regulator protein NarP  58.08 
 
 		 209 aa  237  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.214676  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3330  transcriptional regulator NarP  56.86 
 
 		 215 aa  236  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02120  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarQ or NarX  56.86 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2492  transcriptional regulator NarP  56.86 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0748  transcriptional regulator NarP  56.86 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.251733  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2331  transcriptional regulator NarP  56.86 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1457  transcriptional regulator NarP  56.86 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02079  hypothetical protein  56.86 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2341  transcriptional regulator NarP  56.86 
 
 		 215 aa  236  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.277554 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2430  transcriptional regulator NarP  57.84 
 
 		 215 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.426027  normal  0.504703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2589  transcriptional regulator NarP  57.84 
 
 		 215 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.167087 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2486  transcriptional regulator NarP  57.84 
 
 		 215 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187807  normal  0.0115945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2472  transcriptional regulator NarP  57.84 
 
 		 215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2381  transcriptional regulator NarP  57.84 
 
 		 215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1466  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.37 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25338  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  56.22 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2711  transcriptional regulator NarP  53.66 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.281479  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2406  transcriptional regulator NarP  53.66 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3982  DNA-binding nitrate/nitrite response regulator  51.49 
 
 		 209 aa  204  7e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0929  two component LuxR family transcriptional regulator  52.97 
 
 		 209 aa  204  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000567962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0970  two component LuxR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0307407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0646  response regulator receiver protein  52.48 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0492071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0842  two component LuxR family transcriptional regulator  52.48 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000336278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 209 aa  201  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00236991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0657  two component LuxR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000493749  normal  0.229808 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3365  two component LuxR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000651556  normal  0.0242167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0656  two component LuxR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000830399  normal  0.140804 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0620  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  53 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000275655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3836  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000136397  normal  0.0231387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000161759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0792  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000151034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.5 
 
 		 209 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000464283  hitchhiker  0.00000781977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13730  transcriptional regulator NarL  50.25 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.817999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1229  transcriptional regulator NarL  49.75 
 
 		 219 aa  191  9e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0683  two component LuxR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 209 aa  190  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000388278  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03853  transcriptional regulator NarL  49.75 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000020037  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3089  two component LuxR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0445  two component LuxR family transcriptional regulator  47.03 
 
 		 212 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000143028  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4012  transcriptional regulator NarL  45.85 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1399  transcriptional regulator NarL  44.72 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0261138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0663  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 219 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1951  putative nitrate/nitrite response regulator; NarL  46.04 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120802  normal  0.965323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2900  transcriptional regulator NarL  45.81 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1006  two component LuxR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 219 aa  158  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1766  transcriptional regulator NarL  44.61 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5911  two component LuxR family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  40.49 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2637  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0573022  normal  0.0404034 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  46.8 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5955  two component LuxR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2223  transcriptional regulator NarL  44.61 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134159  normal  0.207388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2926  two component LuxR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 223 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.380263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2299  transcriptional regulator NarL  44.12 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.590018  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3748  two component LuxR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2789  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.59 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.246733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  40.93 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.25 
 
 		 226 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  40.57 
 
 		 242 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1388  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01199  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with NarX (or NarQ)  46.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2425  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00984481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1330  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.724195  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  41.21 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1919  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.11445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2262  transcriptional regulator NarL  45.81 
 
 		 216 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0331529  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01209  hypothetical protein  46.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2402  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000198441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1704  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1371  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.213666  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2568  transcriptional regulator NarL  45.81 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1556  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.109518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1962  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.356331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1904  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  39.72 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1760  two component LuxR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 303 aa  142  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.887336 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1373  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.276843  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1898  transcriptional regulator NarL  46.38 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.335981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7346  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.79 
 
 		 211 aa  141  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0451998 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5384  two component response regulator  41.71 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  38.83 
 
 		 217 aa  141  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  39.02 
 
 		 221 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  39.34 
 
 		 222 aa  139  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21820  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.69 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4675  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.760252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0277  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>