More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003687 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003687  vitamin B12 ABC transporter permease component BtuC  100 
 
 		 337 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02132  vtamin B12-transporter permease  92.45 
 
 		 331 aa  592  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0864  vtamin B12-transporter permease  63.47 
 
 		 335 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2151  vtamin B12-transporter permease  49.11 
 
 		 335 aa  285  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1720  vtamin B12-transporter permease  47.02 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1828  vtamin B12-transporter permease  47.02 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2616  vtamin B12-transporter permease  47.02 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.788864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1625  vtamin B12-transporter permease  49.15 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  46.78 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1451  vtamin B12-transporter permease  45.94 
 
 		 326 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1468  vtamin B12-transporter permease  45.94 
 
 		 326 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1435  vtamin B12-transporter permease  45.94 
 
 		 326 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0354813 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1833  vtamin B12-transporter permease  45.94 
 
 		 326 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.342268  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2005  vtamin B12-transporter permease  45.94 
 
 		 326 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.509358 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2469  vtamin B12-transporter permease  44.95 
 
 		 345 aa  245  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2775  vtamin B12-transporter permease  44.21 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.574344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1791  vtamin B12-transporter permease  48.3 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.979653  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1920  vtamin B12-transporter permease  48.3 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.482495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01680  vtamin B12-transporter permease  48.46 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0444036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1931  transport system permease protein  48.46 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00205827  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1479  vtamin B12-transporter permease  48.46 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.950653 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1930  vtamin B12-transporter permease  48.46 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01669  hypothetical protein  48.46 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.028051  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2429  vtamin B12-transporter permease  48.46 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.175839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1915  vtamin B12-transporter permease  47.96 
 
 		 326 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1654  vtamin B12-transporter permease  46.15 
 
 		 333 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.81431  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.46 
 
 		 370 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  41.28 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  41.28 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  41.28 
 
 		 334 aa  197  3e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  40.13 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.6 
 
 		 371 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  37.03 
 
 		 366 aa  189  4e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  37.76 
 
 		 452 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4009  transport system permease protein  38.87 
 
 		 338 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0785  transport system permease protein  39.46 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3332  transport system permease protein  38.39 
 
 		 338 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2166  transport system permease protein  40.34 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.514643  normal  0.141154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3808  iron chelate ABC transporter permease  38.36 
 
 		 330 aa  182  8.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  37.88 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4865  ABC transporter, iron chelate uptake transporter (FeCT) family, permease protein  38.36 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.737377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0852  transport system permease protein  40.47 
 
 		 337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  37.91 
 
 		 347 aa  180  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  39.29 
 
 		 330 aa  179  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  39.12 
 
 		 370 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  33.53 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 		 342 aa  175  8e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0758  transport system permease protein  37.32 
 
 		 344 aa  175  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0240676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  32.94 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0734  transport system permease protein  36.97 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000599785  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  39.32 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3240  transport system permease protein  39.37 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0167  transport system permease protein  40.61 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1932  transport system permease protein  41.2 
 
 		 356 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  32.94 
 
 		 342 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02205  putative hemin transport system permease transmembrane protein  40.37 
 
 		 323 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.788776  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05240  ABC-type Fe3+-siderophore transporter permease  38.14 
 
 		 345 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2763  transport system permease protein  39.35 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.95 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  36.79 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  33.53 
 
 		 342 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  33.63 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  33.63 
 
 		 342 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  33.63 
 
 		 345 aa  169  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  33.63 
 
 		 345 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2735  ABC transporter membrane spanning protein (hemin)  38.18 
 
 		 361 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1049  transport system permease protein  39.37 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.542405 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0961  transport system permease protein  38.41 
 
 		 343 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001351  hemin ABC transporter permease protein  40.14 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000656529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  33.53 
 
 		 345 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  37.8 
 
 		 358 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  37.2 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3343  transport system permease protein  39.37 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.300006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2461  transport system permease protein  41.64 
 
 		 334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 		 343 aa  165  8e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  37.09 
 
 		 373 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1016  transport system permease protein  39.02 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1211  transport system permease protein  40.75 
 
 		 329 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0947  transport system permease protein  39.02 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  37.72 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  35.58 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2740  transport system permease protein  34.93 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  34.62 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  36.45 
 
 		 345 aa  161  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0275  transport system permease protein  37.01 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  36.2 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0179  transport system permease protein  35.74 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1606  transport system permease protein  32.68 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000330558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  38.27 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3674  hemin ABC transporter, permease protein  37.91 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1443  transport system permease protein  41.08 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0618013  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  34.55 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2323  ABC-type Fe3+-siderophore transport system permease component  35.79 
 
 		 365 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0471491  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  35.37 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  32.18 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5377  hemin ABC-transport system permease  41.2 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0079296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  30.06 
 
 		 336 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1489  transport system permease protein  33.67 
 
 		 373 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2135  transport system permease protein  37.19 
 
 		 357 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370402  normal  0.644336 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2821  transport system permease protein  38.49 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141731  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>