More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003523 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  100 
 
 		 203 aa  416  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  86.7 
 
 		 203 aa  361  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  69.95 
 
 		 212 aa  294  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  66.67 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  66.67 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1713  riboflavin synthase subunit alpha  68.34 
 
 		 217 aa  280  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 213 aa  280  1e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  66.01 
 
 		 213 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  66.01 
 
 		 213 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  66.01 
 
 		 213 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  66.5 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1559  riboflavin synthase subunit alpha  65.52 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.403477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1536  riboflavin synthase subunit alpha  65.52 
 
 		 213 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  69.35 
 
 		 216 aa  274  5e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  66.83 
 
 		 216 aa  274  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  66.5 
 
 		 211 aa  274  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  65.2 
 
 		 218 aa  270  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  65.2 
 
 		 218 aa  269  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  65.2 
 
 		 218 aa  269  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  64.85 
 
 		 203 aa  261  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2099  riboflavin synthase subunit alpha  58.91 
 
 		 204 aa  254  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  58.42 
 
 		 202 aa  234  5.0000000000000005e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  56.35 
 
 		 205 aa  223  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0087  riboflavin synthase subunit alpha  54.23 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0316788  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  51.72 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1762  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117708  normal  0.0239338 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  52.74 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 207 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  51.24 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 205 aa  198  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 207 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 207 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  51.23 
 
 		 203 aa  194  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  50.74 
 
 		 209 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 204 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8148  predicted protein  47.87 
 
 		 188 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.564807  normal  0.0620362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1865  riboflavin synthase subunit alpha  45.32 
 
 		 218 aa  180  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2867  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.999273 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3429  riboflavin synthase subunit alpha  48.22 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2115  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.757101  normal  0.881264 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4731  riboflavin synthase subunit alpha  46.19 
 
 		 235 aa  174  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4077  riboflavin synthase subunit alpha  48.22 
 
 		 238 aa  174  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.578538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2916  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.619819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2775  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.499359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2113  riboflavin synthase subunit alpha  46.27 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3686  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 237 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0704066  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5522  riboflavin synthase subunit alpha  46.7 
 
 		 237 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.189133  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3729  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.794278  normal  0.402908 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4568  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3795  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  0.214246 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2300  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 237 aa  167  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.745499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1243  riboflavin synthase, alpha subunit  46.34 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5723  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 234 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3144  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.212447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4434  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.563917  normal  0.0752647 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  40.21 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  43.85 
 
 		 197 aa  139  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.41 
 
 		 200 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  37.07 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  35.15 
 
 		 214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  40.2 
 
 		 215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  35.15 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 		 199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  35.33 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  38.05 
 
 		 217 aa  128  4.0000000000000003e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  36.63 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  37.81 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  38.04 
 
 		 196 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 		 221 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  36.9 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.83 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  36.41 
 
 		 213 aa  126  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 		 221 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  34.34 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  37.88 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  35.32 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 216 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  36.41 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  35.47 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  35.35 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  36.96 
 
 		 200 aa  122  4e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  34.62 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  35.87 
 
 		 217 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  40.36 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>