More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003268 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  100 
 
 		 210 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  32.52 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  32.52 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  32.52 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  32.52 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  31.9 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  33.83 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  31.9 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  31.82 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  29.38 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  33.08 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  34.86 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  32.73 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  32.92 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  29.03 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  29.52 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4557  thiopurine S-methyltransferase  29.8 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  29.52 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  32.65 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  29.52 
 
 		 541 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3813  methyltransferase type 12  26.99 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.332384  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.27 
 
 		 541 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2280  methyltransferase type 12  30.97 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  36.47 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  29.52 
 
 		 541 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  42.11 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  26.62 
 
 		 277 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  35.54 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 250 aa  57  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  31.47 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.3 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.84 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 264 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  37.84 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  27.66 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.43 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  25.27 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5451  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.72 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  29.84 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.73 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12690  hypothetical protein  36.25 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.09325e-49  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 251 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1033  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00915374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 264 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 		 253 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  28.16 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3396  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  29.6 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.91 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 253 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 		 253 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  26.79 
 
 		 267 aa  52.4  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1721  Methyltransferase type 12  25.3 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000160081 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.36 
 
 		 261 aa  52  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0034  methyltransferase type 12  32.14 
 
 		 267 aa  52.4  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 250 aa  51.6  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 246 aa  51.6  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  27.73 
 
 		 257 aa  51.6  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 		 253 aa  51.6  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4758  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 264 aa  51.6  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  36.76 
 
 		 266 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 311 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 253 aa  50.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.58 
 
 		 251 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  33.03 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10570  benzoquinone methyltransferase  26.92 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.175539  normal  0.480356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>