More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003039 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003039  membrane protein suppressor for copper-sensitivity ScsD  100 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02846  hypothetical protein  76.82 
 
 		 170 aa  258  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0759  putative suppressor for copper-sensitivity D  48.32 
 
 		 178 aa  161  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1378  thioredoxin family protein  47.65 
 
 		 175 aa  161  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3548  redoxin domain-containing protein  43.24 
 
 		 182 aa  141  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3198  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.74 
 
 		 188 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0116  redoxin domain-containing protein  44 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0665765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3003  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.6 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0578774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4355  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.8 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4223  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  42.55 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4151  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.07 
 
 		 174 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0365  thioredoxin protein  35.76 
 
 		 187 aa  106  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3452  suppressor for copper-sensitivity D, putative  34.42 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1431  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 184 aa  104  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.37409  hitchhiker  0.00436762 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3117  thioredoxin, putative  32.67 
 
 		 184 aa  103  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0406  putative thioredoxin protein  33.77 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1443  redoxin domain-containing protein  32.24 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1378  redoxin domain-containing protein  30.92 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.519735  hitchhiker  0.000299029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0565  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.25 
 
 		 183 aa  96.3  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.711291  hitchhiker  0.0029887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2523  thioredoxin-like protein  28.86 
 
 		 223 aa  93.6  8e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.741385  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0501  putative thioredoxin  28.1 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3348  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.37 
 
 		 166 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2340  redoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2196  thioredoxin, putative  31.17 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.104453 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1075  suppressor for copper-sensitivity D  34.44 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1226  suppressor for copper-sensitivity D  33.77 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.608659 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2705  redoxin domain-containing protein  31.14 
 
 		 193 aa  87  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0225  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.33 
 
 		 179 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.55912  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1180  suppressor for copper-sensitivity D  33.33 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1191  suppressor for copper-sensitivity D  33.33 
 
 		 168 aa  85.1  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1211  suppressor for copper-sensitivity D  33.33 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.746268  normal  0.80439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3068  suppressor for copper-sensitivity D, putative  30.26 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1759  thioredoxin, putative  27.08 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0176  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.26 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.102737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0494  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.62 
 
 		 210 aa  63.5  0.0000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.779352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0403  suppressor for copper-sensitivity D, putative  26.81 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0340  hypothetical protein  30.82 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2277  Thioredoxin domain protein  27.21 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00669131  hitchhiker  0.000000625569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2143  Thioredoxin domain protein  29.46 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  25.17 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  31.4 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  25.34 
 
 		 403 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  24.24 
 
 		 403 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3231  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.45 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0496837 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08920  thioredoxin  27.97 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000942681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1006  thioredoxin  33.88 
 
 		 259 aa  52.8  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3868  Thioredoxin domain protein  27.03 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.35 
 
 		 409 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.12 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0367  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.73 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3917  thioredoxin domain protein  28.16 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00595323  normal  0.342893 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3280  thioredoxin-related protein  29.37 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0354  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.89 
 
 		 191 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  30.1 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3229  thioredoxin-related protein  27.27 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000047722  normal  0.231945 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.1 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1239  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.57 
 
 		 422 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.502856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1146  thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  32.29 
 
 		 433 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.299964  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0031  thioredoxin  26.27 
 
 		 110 aa  50.8  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1343  thioredoxin  31.37 
 
 		 105 aa  50.4  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1539  redoxin domain-containing protein  26.67 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.482949  normal  0.281635 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0691  thioredoxin  22.13 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0160  thioredoxin-related  23.48 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0506  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  24.83 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0010915  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1070  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.61 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  30.77 
 
 		 167 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0265  thioredoxin  29.52 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.28448  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0301  thioredoxin  27.1 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04950  thioredoxin  29.73 
 
 		 105 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  52.78 
 
 		 286 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  25.23 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  27.03 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7329  thioredoxin  25.44 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.231985  normal  0.658106 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3594  thioredoxin  31.15 
 
 		 257 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0521557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0365  periplasmic protein thiol  26.15 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.69916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  28.45 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1234  redoxin domain-containing protein  25 
 
 		 167 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39568  thioredoxin  26.36 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.187057 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3582  thioredoxin  25.23 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.968394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0945  thioredoxin domain-containing protein  27.12 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.148607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1708  thioredoxin  29.91 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00102285  normal  0.772138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6120  redoxin domain-containing protein  28 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16555  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3822  putative thioredoxin  36.21 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.644902  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1093  thioredoxin  25.24 
 
 		 268 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0251638  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0510  putative secreted protein  27.56 
 
 		 209 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113668  normal  0.171566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39680  thioredoxin  24.24 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.333633 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1625  thioredoxin  28.16 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1612  redoxin domain-containing protein  30.97 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1896  thioredoxin  24.79 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00263225  hitchhiker  0.00000000000000449088 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  27.35 
 
 		 109 aa  48.1  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  28.57 
 
 		 290 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03730  thiol-disulfide isomerase-like thioredoxin  28.43 
 
 		 212 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0104824  normal  0.12424 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  26.13 
 
 		 106 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0836  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.23 
 
 		 202 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  unclonable  0.000000000312074 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1016  thioredoxin domain-containing protein  27.27 
 
 		 105 aa  48.1  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0904  thioredoxin  26.21 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000201022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  32.56 
 
 		 169 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6430  thioredoxin  29.81 
 
 		 106 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2134  thioredoxin  27 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0459983  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  29 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>