186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001941 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001941  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  100 
 
 		 183 aa  345  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4133  transport-associated  49.73 
 
 		 188 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3707  transport-associated  59.2 
 
 		 181 aa  167  6e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.101636  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01237  putative hyperosmotically inducible periplasmic protein  54.22 
 
 		 175 aa  161  6e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.315155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3995  transport-associated  55.49 
 
 		 182 aa  158  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000543546  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  46.96 
 
 		 187 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1415  transport-associated  54.64 
 
 		 184 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1317  transport-associated  53.37 
 
 		 181 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1441  transport-associated  55.03 
 
 		 184 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2939  transport-associated  55.03 
 
 		 184 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.537293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1405  transport-associated protein  53.85 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2744  transport-associated  59.06 
 
 		 182 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2676  transport-associated  58.39 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2851  transport-associated  58.39 
 
 		 182 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0258  histidine kinase  36.6 
 
 		 222 aa  88.2  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.469068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5094  transport-associated  32.53 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0983587  normal  0.219919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0177  transport-associated  34.03 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0149  transport-associated  32.93 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0134  transport-associated protein  31.55 
 
 		 273 aa  74.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.892998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0151  transport-associated  31.74 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  30.63 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  30 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2185  transport-associated  32.45 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0552  periplasmic protein  32.67 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.783524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1784  transport-associated  36.76 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0010501  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2261  transport-associated  32.64 
 
 		 282 aa  64.3  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  31.94 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0826  transport-associated  29.11 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0362569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0454  periplasmic protein  31.33 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.390695  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3503  periplasmic protein  34.9 
 
 		 204 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3632  periplasmic protein  34.9 
 
 		 204 aa  62  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0836  periplasmic protein  35.66 
 
 		 204 aa  62  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  31.25 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0653  periplasmic protein  31.54 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4919  periplasmic protein  32.87 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.618733  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0106  hypothetical protein  35.34 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.277757  normal  0.0163837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3263  transport-associated protein  31.58 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369629  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2553  hypothetical protein  35.54 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4923  periplasmic protein  32.17 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.497608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  33.07 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04251  periplasmic protein  32.17 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.368391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3623  transport-associated  32.17 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04217  hypothetical protein  32.17 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.310729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3681  periplasmic protein  32.17 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.261916  hitchhiker  0.00179473 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4610  periplasmic protein  32.17 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0762495  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4973  periplasmic protein  32.17 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00297721  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3297  transport-associated  30.2 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.173268  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5888  periplasmic protein  32.17 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.223121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4116  transport-associated protein  31.97 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2300  transport-associated  31.17 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.53534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1025  OsmY domain-containing protein  29.08 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4422  lipoprotein, putative  31.97 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303803  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0155  OsmY domain-containing protein  29.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1324  OsmY domain-containing protein  29.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2759  putative phospholipid-binding protein  29.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2616  putative phospholipid-binding protein  29.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0180  OsmY domain-containing protein  29.08 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5932  transport-associated protein  28.87 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4882  periplasmic protein  31.54 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0715597  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4976  periplasmic protein  31.54 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.163142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4815  periplasmic protein  31.54 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4969  periplasmic protein  31.54 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4917  periplasmic protein  31.54 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.292031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0632  transport-associated  33.33 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1322  transport-associated protein  33.61 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0500  transport-associated protein  33.33 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.476678 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  31.78 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0273  transport-associated  33.33 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0122562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2814  transport-associated  33.33 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0292  transport-associated  33.33 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  30.3 
 
 		 284 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  31.78 
 
 		 265 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4526  transport-associated  33.61 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57510  putative secreted lipoprotein  33.61 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4402  transport-associated  33.61 
 
 		 192 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.148625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0930  transport-associated  32.79 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4998  putative lipoprotein  33.61 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.263747  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0407  transport-associated  33.98 
 
 		 265 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3393  periplasmic or secreted lipoprotein  32.56 
 
 		 265 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4311  periplasmic phospholipid binding protein  33.98 
 
 		 264 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2203  transport-associated  30.47 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.801164  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0199  transport-associated protein  30.83 
 
 		 265 aa  51.2  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  27.82 
 
 		 220 aa  51.2  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13110  hypothetical protein  30 
 
 		 161 aa  51.2  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0073  transport-associated  26.85 
 
 		 196 aa  51.2  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3875  transport-associated  31.97 
 
 		 214 aa  51.2  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.835805  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1200  transport-associated  27.92 
 
 		 217 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.649848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  45.16 
 
 		 114 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  45.16 
 
 		 114 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0535  periplasmic protein  29.37 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.388761  hitchhiker  0.00819185 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0125  transport-associated  29.29 
 
 		 267 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  31.78 
 
 		 265 aa  51.2  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04303  putative phospholipid-binding domain family  48.39 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4687  transport-associated protein  31.97 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.314355  normal  0.0505791 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2285  transport-associated  33.61 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3585  periplasmic protein  28.67 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  35.71 
 
 		 120 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  30.23 
 
 		 266 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  30.23 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>