131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001780 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001780  putative glycosyltransferase  100 
 
 		 308 aa  637    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5728  putative glycosyltransferase  40.87 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0792  Fis family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  25.36 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.43 
 
 		 396 aa  60.1  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1089  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3748  glycosyl transferase  25.84 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.985214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0857  glycosyl transferase group 1  25 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.123894  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1586  glycosyl transferase, group 1  23.76 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.381696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  25.78 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.28 
 
 		 405 aa  55.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 		 1177 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.31 
 
 		 375 aa  53.9  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  25.44 
 
 		 373 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  24.89 
 
 		 363 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 418 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 		 386 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  28.03 
 
 		 386 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2738  glycosyl transferase group 1  23.94 
 
 		 400 aa  52  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0243  glycosyl transferase group 1  23.83 
 
 		 374 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0540597  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  29.93 
 
 		 398 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5718  glycosyl transferase, group 1  25.24 
 
 		 411 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.69 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1197  glycosyl transferase, group 1  22.58 
 
 		 374 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 750 aa  50.8  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 377 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  22.16 
 
 		 371 aa  50.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2023  glycosyl transferase, group 1  22.26 
 
 		 401 aa  50.4  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.334553  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0569  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1099  glycosyl transferase, group 1  24.76 
 
 		 411 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.593469  normal  0.7916 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0579  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 		 398 aa  50.1  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1306  glycosyl transferase group 1  27.05 
 
 		 403 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  24.67 
 
 		 380 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 375 aa  49.3  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.67 
 
 		 377 aa  49.3  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 426 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  26.4 
 
 		 401 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0506  glycosyl transferase, group 1  21.79 
 
 		 425 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  22.7 
 
 		 1177 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  23.81 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1804  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 415 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0579  sulfolipid sulfoquinovosyldiacylglycerol biosynthesis protein  24.05 
 
 		 377 aa  47.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.513517  normal  0.138904 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  24.06 
 
 		 395 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0054  glycosyl transferase group 1  20.44 
 
 		 364 aa  47.8  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000226756  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0592  general glycosylation pathway protein  29.86 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.570746  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1271  general glycosylation pathway protein  29.86 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.507421  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  23.55 
 
 		 396 aa  47.4  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1675  glycosyl transferase, group 1  29.9 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.447182  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1471  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 383 aa  47.4  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.630233  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  26.35 
 
 		 370 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  23.83 
 
 		 383 aa  47  0.0004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0050  glycosyl transferase  25 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000688339  normal  0.0134291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 373 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4068  group 1 glycosyl transferase  25.7 
 
 		 501 aa  46.6  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.736051  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  24.69 
 
 		 375 aa  46.6  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  23.59 
 
 		 388 aa  46.6  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0352  glycosyl transferase group 1  21.82 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1151  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0358  glycosyl transferase group 1  21.97 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0154826  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5102  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 408 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  29.01 
 
 		 739 aa  46.2  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5190  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 408 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5481  glycosyl transferase, group 1  27.65 
 
 		 408 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.931135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  25.63 
 
 		 348 aa  45.8  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3658  glycosyl transferase group 1  23.27 
 
 		 452 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0710404  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1359  glycosyltransferase  26.21 
 
 		 381 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1146  general glycosylation pathway protein  29.17 
 
 		 359 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  23.61 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0851  glycosyl transferase group 1  40 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3898  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 433 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  32.22 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3880  glycosyl transferase group 1  21.74 
 
 		 366 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  28.48 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 426 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  22.26 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1265  SqdX  25.3 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  21.62 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  25.15 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2765  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 		 432 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21361  SqdX  25.78 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  22.91 
 
 		 405 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  21.71 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  24.89 
 
 		 468 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5607  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  25.12 
 
 		 2401 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0309  glycosyl transferase, group 1  21.21 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  24.49 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2371  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1097  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 		 349 aa  43.9  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.372916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>