More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1365 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 322 aa  648    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  40.31 
 
 		 324 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  39.69 
 
 		 324 aa  209  6e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  37.2 
 
 		 323 aa  207  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.91 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.58 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  35.67 
 
 		 323 aa  199  6e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  40.06 
 
 		 324 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  36.74 
 
 		 313 aa  198  7.999999999999999e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.89 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  36.86 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  38.04 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2823  octaprenyl-diphosphate synthase  36.22 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000462084  normal  0.156809 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.24 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  37.54 
 
 		 313 aa  194  2e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  34.45 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.48 
 
 		 322 aa  192  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  35.98 
 
 		 323 aa  192  9e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.97 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  36.42 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  37.7 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2658  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0590185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  34.71 
 
 		 325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  34.06 
 
 		 343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  35.99 
 
 		 320 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  34.6 
 
 		 322 aa  189  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.62 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  36.27 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.64 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  35.62 
 
 		 342 aa  189  8e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  36.71 
 
 		 322 aa  189  8e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  35.45 
 
 		 323 aa  188  9e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  34.15 
 
 		 323 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.32 
 
 		 326 aa  188  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0281  trans-hexaprenyltranstransferase  37.7 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  36.83 
 
 		 349 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.24 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.64 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  35.26 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  33.97 
 
 		 325 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2345  polyprenyl synthetase  37.27 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000529379  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.65 
 
 		 323 aa  186  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  36.04 
 
 		 359 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  39.54 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  34.59 
 
 		 341 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 356 aa  186  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.07 
 
 		 320 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 335 aa  185  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  34.38 
 
 		 331 aa  186  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  31.86 
 
 		 322 aa  185  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  35.16 
 
 		 323 aa  185  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  35.9 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  34.97 
 
 		 330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  35.31 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  34.63 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  35.46 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  34.45 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  36.36 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  36.25 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 322 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  33.86 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  33.75 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  33.33 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  33.95 
 
 		 322 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 327 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  34.7 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  34.74 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  32.92 
 
 		 345 aa  182  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0053  trans-hexaprenyltrans transferase  36.19 
 
 		 325 aa  182  9.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  33.85 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.29 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  32.81 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  33.12 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.1 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  31.96 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.62 
 
 		 320 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  31.96 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  34.16 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  31.96 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  31.96 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  36.79 
 
 		 327 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  31.96 
 
 		 323 aa  180  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  34.81 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.48 
 
 		 320 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.17 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  31.96 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.17 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.17 
 
 		 323 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.17 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.56 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.17 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  31.96 
 
 		 323 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  34.08 
 
 		 348 aa  179  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  33.44 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  31.96 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>