More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0106 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0106  Prephenate dehydrogenase  100 
 
 
290 aa  587  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1009  Prephenate dehydrogenase  40.14 
 
 
364 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000207637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3803  Prephenate dehydrogenase  38.23 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000296114  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1150  prephenate dehydrogenase  37.33 
 
 
299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0141038  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1150  Prephenate dehydrogenase  37.72 
 
 
367 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2023  prephenate dehydrogenase  35.82 
 
 
328 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1796  prephenate dehydrogenase  31.05 
 
 
365 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1346  prephenate dehydrogenase  36.1 
 
 
287 aa  149  4e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2997  prephenate dehydrogenase  35.34 
 
 
328 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  0.0386935 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2881  Prephenate dehydrogenase  31.87 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.525395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1203  prephenate dehydrogenase  36.61 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1803  Prephenate dehydrogenase  36.07 
 
 
373 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.411636  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06830  prephenate dehydrogenase  36.4 
 
 
379 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.397178 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23310  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.55 
 
 
746 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0308529 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1206  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.9 
 
 
780 aa  145  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.610993 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2695  prephenate dehydrogenase  31.05 
 
 
366 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1852  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.78 
 
 
746 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1886  cyclohexadienyl/prephenate dehydrogenase  35.5 
 
 
288 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000040742  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0692  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
368 aa  144  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1182  prephenate dehydrogenase  37.15 
 
 
364 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2954  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 
366 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0651000000000002e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2745  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 
366 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2954  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 
378 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.140403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1463  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
286 aa  142  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000154009  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0483  prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 
367 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1426  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 
363 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4079  prephenate dehydrogenase  35.23 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1248  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.99 
 
 
770 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.757925  normal  0.0192474 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1455  prephenate dehydrogenase  31.77 
 
 
363 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0863  prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2607  prephenate dehydrogenase  32.03 
 
 
290 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.535811  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2995  prephenate dehydrogenase  30.32 
 
 
378 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.15809  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2674  prephenate dehydrogenase  30.32 
 
 
366 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0930  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
293 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000476657  normal  0.448551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1074  prephenate dehydrogenase  33.45 
 
 
293 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1965  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.22 
 
 
746 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1426  prephenate dehydrogenase  32.48 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000102552  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2136  prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 
367 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.535624  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2195  prephenate dehydrogenase  34.15 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.598463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0743  prephenate dehydrogenase  34.38 
 
 
334 aa  139  6e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0566  prephenate dehydrogenase  34.89 
 
 
291 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1025  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.1 
 
 
742 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17721  arogenate dehydrogenase  37.1 
 
 
279 aa  139  7.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1333  prephenate dehydrogenase  38.1 
 
 
375 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000339582  normal  0.134491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2019  Prephenate dehydrogenase  34.65 
 
 
289 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2748  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 
369 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1184  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.76 
 
 
778 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.372461 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17561  arogenate dehydrogenase  36.65 
 
 
279 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1349  prephenate dehydrogenase  33.87 
 
 
334 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000774575  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0596  arogenate dehydrogenase  32.28 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0611  arogenate dehydrogenase  32.28 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.423304  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  33.09 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4928  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.35 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0725  prephenate dehydrogenase  37.6 
 
 
339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0130127  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16841  arogenate dehydrogenase  35.77 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1234  prephenate dehydrogenase  35.11 
 
 
289 aa  136  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3001  prephenate dehydrogenase  29.6 
 
 
366 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1377  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.48 
 
 
746 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1003  prephenate dehydrogenase  35.61 
 
 
308 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.28 
 
 
311 aa  135  5e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2283  prephenate dehydrogenase  29.96 
 
 
366 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000918278 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0565  prephenate dehydrogenase  35.61 
 
 
329 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1044  prephenate dehydrogenase  35.61 
 
 
329 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1939  prephenate dehydrogenase  32.85 
 
 
280 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3037  Prephenate dehydrogenase  34.4 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0470856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10360  Prephenate dehydrogenase  33.03 
 
 
291 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1657  arogenate dehydrogenase  35.29 
 
 
279 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  32.72 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3085  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.36 
 
 
319 aa  134  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.67 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3644  prephenate dehydrogenase  33.22 
 
 
534 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0309722  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2957  prephenate dehydrogenase  29.24 
 
 
366 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15850  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.1 
 
 
752 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1914  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.64 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2149  Prephenate dehydrogenase  32.28 
 
 
288 aa  132  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3900  prephenate dehydrogenase  34.48 
 
 
278 aa  132  5e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174152  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1988  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.29 
 
 
321 aa  132  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0385  arogenate dehydrogenase  36.94 
 
 
308 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.94056  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1748  prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase family protein  34.15 
 
 
535 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0692741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2573  prephenate dehydrogenase  34.05 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4157  prephenate dehydrogenase  36.74 
 
 
308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.718044 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4074  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.33 
 
 
735 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00116499  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2146  bifunctional cyclohexadienyl dehydrogenase/ 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.53 
 
 
745 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.470632  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0920  prephenate dehydrogenase  35.98 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0948545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2260  prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 
322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.341011  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3872  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.63 
 
 
307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.0868763 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2574  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.74 
 
 
749 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593248  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0936  prephenate dehydrogenase  30.32 
 
 
362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0199  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.74 
 
 
749 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0949  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.74 
 
 
749 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17521  arogenate dehydrogenase  32.28 
 
 
279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3579  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.99 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0656619 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2947  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.74 
 
 
749 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4102  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.11 
 
 
314 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.639306  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2884  bifunctional prephenate dehydrogenase/3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.74 
 
 
753 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.052366  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1195  prephenate dehydrogenase  30.69 
 
 
286 aa  129  7.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4284  cyclohexadienyl dehydrogenase  32.18 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0191786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4033  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.03 
 
 
311 aa  129  8.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0582  cyclohexadienyl dehydrogenase  31.94 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4397  arogenate dehydrogenase  30.71 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229138  hitchhiker  0.0000184997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>