92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1612 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1678  hypothetical protein  92.96 
 
 
412 aa  778    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.44892  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1612  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  825    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111246  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1357  hypothetical protein  33.24 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.70746  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0817  hypothetical protein  30 
 
 
427 aa  191  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0940  hypothetical protein  31 
 
 
393 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0929  hypothetical protein  31.03 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.501071  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  25.28 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2888  hypothetical protein  26.19 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  29.01 
 
 
380 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2204  hypothetical protein  26.34 
 
 
404 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.313658  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5109  hypothetical protein  28.38 
 
 
564 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344799  normal  0.106863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1404  hypothetical protein  29.69 
 
 
479 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0622299  hitchhiker  0.00217625 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1973  hypothetical protein  25.25 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2121  hypothetical protein  25.25 
 
 
362 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2156  hypothetical protein  25.25 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3160  hypothetical protein  27.22 
 
 
442 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1952  hypothetical protein  25.25 
 
 
404 aa  63.5  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2273  hypothetical protein  25.25 
 
 
404 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1928  hypothetical protein  25.82 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.50924  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2276  protein of unknown function DUF58  24.89 
 
 
398 aa  62.4  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.29626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2133  hypothetical protein  26.34 
 
 
405 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3182  hypothetical protein  25.81 
 
 
404 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19010  uncharacterized conserved protein (some members contain a von Willebrand factor type A (vWA) domain)  26.48 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0623  hypothetical protein  24.11 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1118  protein of unknown function DUF58  27.6 
 
 
391 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1967  hypothetical protein  25.81 
 
 
405 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.986855  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1099  hypothetical protein  21.45 
 
 
392 aa  60.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.430277  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1352  hypothetical protein  26.75 
 
 
433 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.491685  hitchhiker  0.00000471163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0290  protein of unknown function DUF58  24.56 
 
 
428 aa  58.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3033  hypothetical protein  22.52 
 
 
369 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3072  hypothetical protein  21.99 
 
 
369 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0261289  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1430  protein of unknown function DUF58  27.93 
 
 
369 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1585  protein of unknown function DUF58  27.5 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.570583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3016  hypothetical protein  24.39 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0705  protein of unknown function DUF58  26.11 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2758  hypothetical protein  22.12 
 
 
369 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0601  hypothetical protein  26.29 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.007011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2772  hypothetical protein  21.92 
 
 
369 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.23547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1710  protein of unknown function DUF58  22.69 
 
 
401 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3037  hypothetical protein  22.55 
 
 
369 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.384014  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2823  hypothetical protein  22.55 
 
 
369 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3015  hypothetical protein  24.39 
 
 
387 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.165338 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0449  protein of unknown function DUF58  24.55 
 
 
381 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3803  hypothetical protein  21.51 
 
 
380 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.544146  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2736  hypothetical protein  24.8 
 
 
387 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0801  hypothetical protein  25 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2755  hypothetical protein  24.39 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00204015  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2226  hypothetical protein  22.86 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000308564 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3067  hypothetical protein  22.12 
 
 
369 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3054  hypothetical protein  24.8 
 
 
387 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.176389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2913  hypothetical protein  24.23 
 
 
387 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.509906  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3053  hypothetical protein  24.58 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2816  hypothetical protein  24.58 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0319  hypothetical protein  23.49 
 
 
369 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0281  hypothetical protein  25.09 
 
 
380 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0262766  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  25.77 
 
 
363 aa  50.4  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2859  hypothetical protein  26.09 
 
 
418 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.515682 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3074  hypothetical protein  23.97 
 
 
424 aa  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.144067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2804  hypothetical protein  23.98 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.020918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3017  hypothetical protein  23.98 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4816  protein of unknown function DUF58  24.84 
 
 
453 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1055  hypothetical protein  26.67 
 
 
402 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2937  protein of unknown function DUF58  20.7 
 
 
415 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000893199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3811  hypothetical protein  26.2 
 
 
380 aa  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0193  hypothetical protein  29.6 
 
 
432 aa  47.4  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.0000145617  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0959  hypothetical protein  25.71 
 
 
407 aa  47  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0493  protein of unknown function DUF58  22.55 
 
 
398 aa  47  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  26.44 
 
 
267 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2826  protein of unknown function DUF58  25.9 
 
 
362 aa  47  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.493704  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2684  conserved repeat domain protein  29.25 
 
 
391 aa  46.6  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0204588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3459  hypothetical protein  20.93 
 
 
431 aa  46.6  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.887952  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1587  protein of unknown function DUF58  23.86 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.65866  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4604  hypothetical protein  24.38 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  34.78 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0388  protein of unknown function DUF58  27.55 
 
 
372 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0885  protein of unknown function DUF58  19.4 
 
 
413 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  22.22 
 
 
321 aa  45.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2147  protein of unknown function DUF58  38.1 
 
 
358 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1650  protein of unknown function DUF58  23.01 
 
 
463 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559538 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3113  hypothetical protein  22.4 
 
 
391 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7351  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  31.5 
 
 
276 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2537  protein of unknown function DUF58  23.89 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0165  hypothetical protein  25.84 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  21.11 
 
 
327 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1150  protein of unknown function DUF58  26.94 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00641052  hitchhiker  0.0000843789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3233  hypothetical protein  20.16 
 
 
431 aa  44.3  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.501295  normal  0.0364407 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0439  protein of unknown function DUF58  26.9 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  23.14 
 
 
385 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0999  hypothetical protein  19.46 
 
 
422 aa  43.9  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.443397  normal  0.215623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2774  hypothetical protein  25.31 
 
 
411 aa  43.5  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0075  hypothetical protein  25.12 
 
 
436 aa  43.1  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.258844  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1209  hypothetical protein  25.21 
 
 
463 aa  43.1  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>