175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1354 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1354  initiation factor 2B related  100 
 
 		 234 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1332  initiation factor 2B related  90.17 
 
 		 234 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126468  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1178  initiation factor 2B related  41.3 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1938  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.9 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0331  translation initiation factor, aIF-2BII family  25.29 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10674  predicted protein  33.04 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.337525  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1262  translation initiation factor IF-2B subunit delta  31.9 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156828  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_61090  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit (GCN3)  30.87 
 
 		 311 aa  66.2  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.571907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  28.87 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0557  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.59 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0282254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2314  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.21 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2704  initiation factor 2B related  30.28 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3564  initiation factor 2B related protein  31.18 
 
 		 505 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2432  translation initiation factor IF-2B subunit delta  24.55 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2012  initiation factor 2B related  27.86 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  28.44 
 
 		 351 aa  60.1  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0384  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.33 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.111584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2067  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.88 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.15 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0673  translation initiation factor IF-2B subunit delta  25.58 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0385  initiation factor 2B related  27.46 
 
 		 319 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0793  translation initiation factor IF-2B subunit delta  27.98 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0257  translation initiation factor IF-2B subunit delta  28.23 
 
 		 318 aa  58.5  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.374492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1398  initiation factor 2B related  31.41 
 
 		 414 aa  58.5  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0074  initiation factor 2B related  27.78 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.97 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2762  translation initiation factor IF-2B subunit delta  29.27 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00225031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.58 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2269  translation initiation factor IF-2B subunit delta  26.26 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0752053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0571  translation initiation factor, aIF-2BII family  26.53 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  28.8 
 
 		 347 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  34.31 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1576  initiation factor 2B related protein  34.45 
 
 		 467 aa  55.5  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.649962  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01730  hypothetical protein  32.43 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  28.65 
 
 		 347 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  28.21 
 
 		 344 aa  55.5  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1741  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.23 
 
 		 355 aa  55.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.84 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.81 
 
 		 353 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  29.03 
 
 		 343 aa  54.7  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2731  methylthioribose-1-phosphate isomerase  30.13 
 
 		 349 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0228866  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2966  translation initiation factor, aIF-2BII family  35.29 
 
 		 351 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00871533  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  29.03 
 
 		 343 aa  54.7  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  27.33 
 
 		 354 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  27.49 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  28 
 
 		 348 aa  53.9  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  29.01 
 
 		 346 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  27.65 
 
 		 346 aa  53.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  26.85 
 
 		 346 aa  53.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.6 
 
 		 344 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  25.73 
 
 		 344 aa  53.1  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  25.71 
 
 		 346 aa  53.1  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  23.19 
 
 		 353 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00167  translation initiation factor eIF-2B alpha subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11340)  36.08 
 
 		 352 aa  52.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  25.73 
 
 		 350 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  27.01 
 
 		 350 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  27.05 
 
 		 351 aa  52  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.01 
 
 		 350 aa  52  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  31.21 
 
 		 339 aa  52  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.21 
 
 		 328 aa  52  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1400  translation initiation factor, aIF-2BI family  25.63 
 
 		 354 aa  52  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0211329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  22.78 
 
 		 337 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.99 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3447  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.89 
 
 		 342 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.45 
 
 		 357 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.99 
 
 		 351 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.85 
 
 		 351 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.85 
 
 		 351 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  32.04 
 
 		 348 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  31 
 
 		 345 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0674  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.18 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.887106  normal  0.0224655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  28.86 
 
 		 342 aa  50.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3300  translation initiation factor, aIF-2BI family  24.62 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  25.13 
 
 		 354 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0662  aIF-2BI family translation initiation factor  25.11 
 
 		 365 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437714 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1543  translation initiation factor, aIF-2BI family  29.46 
 
 		 333 aa  50.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0321135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.43 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.85 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.67 
 
 		 347 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  28.57 
 
 		 346 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  22.85 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2118  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  27.45 
 
 		 339 aa  50.1  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  24.22 
 
 		 352 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  26.26 
 
 		 342 aa  50.1  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.89 
 
 		 348 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.18 
 
 		 348 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.18 
 
 		 347 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  30 
 
 		 353 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  23.83 
 
 		 350 aa  49.7  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.18 
 
 		 348 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  34.95 
 
 		 321 aa  49.7  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.18 
 
 		 348 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0008  translation initiation factor IF-2B subunit alpha  30.56 
 
 		 351 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.679741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.18 
 
 		 348 aa  49.3  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6183  aIF-2BI family translation initiation factor  26.95 
 
 		 365 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  30.2 
 
 		 345 aa  48.9  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  24.08 
 
 		 356 aa  48.9  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  27.89 
 
 		 348 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0641  translation initiation factor, aIF-2BI family  27.55 
 
 		 365 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  26.7 
 
 		 348 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>