More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0730 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  100 
 
 
206 aa  400  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  96.12 
 
 
206 aa  388  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1140  ABC transporter related  51.69 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
219 aa  201  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
219 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  49.51 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  49.51 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0162  ABC transporter, ATP-binding protein  51.24 
 
 
219 aa  199  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5080  ABC transporter, ATP-binding protein  49.51 
 
 
219 aa  198  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  49.02 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4759  ABC transporter related  48.76 
 
 
219 aa  191  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15620  ABC transporter related  48.06 
 
 
212 aa  178  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1096  ABC transporter related  36.82 
 
 
203 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0596237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
222 aa  131  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  36.27 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  38.03 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  37.86 
 
 
244 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  37.43 
 
 
255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2373  ABC transporter related  38.1 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  38.81 
 
 
264 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  34.86 
 
 
980 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  34.17 
 
 
253 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  35.38 
 
 
228 aa  123  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3346  ABC transporter related  37.57 
 
 
532 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.280476  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0442  ABC transporter related  32.18 
 
 
305 aa  122  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0739  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydC  38.89 
 
 
586 aa  122  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0348008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3711  type I secretion system ATPase  36.06 
 
 
742 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.841937  normal  0.327793 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0471  ABC transporter related  36.82 
 
 
240 aa  122  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.185653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4676  Sigma 54 interacting domain protein  35.16 
 
 
234 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3319  type I secretion system ATPase  33.78 
 
 
712 aa  121  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1400  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
219 aa  121  9e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  35 
 
 
251 aa  121  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  34.87 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  32.51 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  37.84 
 
 
242 aa  120  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4474  ABC transporter related  37.16 
 
 
227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3473  ABC transporter related  37.02 
 
 
532 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0115925 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 
276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  35.48 
 
 
234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2084  ABC transporter related  36.36 
 
 
239 aa  119  3e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 
595 aa  119  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  34.36 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  34.36 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3672  ABC transporter related  36.87 
 
 
533 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0076  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 
235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.514919 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  33.84 
 
 
242 aa  118  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  36.04 
 
 
235 aa  118  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.28 
 
 
376 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0278  ABC transporter related protein  33.84 
 
 
252 aa  118  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  34.54 
 
 
264 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  35.53 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  33.51 
 
 
408 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  37.3 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2470  ABC transporter related  31.22 
 
 
577 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682196  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3531  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
341 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17580  ABC transporter related  36.14 
 
 
244 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000826667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.31 
 
 
281 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  32.51 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1664  type I secretion system ATPase  31.48 
 
 
718 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.137187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3993  ABC transporter related  36.61 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222107  normal  0.622959 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0992  type I secretion system ATPase  32 
 
 
712 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4362  ABC transporter related  36.61 
 
 
230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1977  ABC transporter related  34.27 
 
 
221 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00231663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3466  efflux ABC transporter ATP-binding protein  30.24 
 
 
569 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.04 
 
 
301 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3226  ABC transporter-related protein  34.42 
 
 
579 aa  116  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1114  ABC transporter related  34.45 
 
 
233 aa  116  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16611  ABC transporter, ATP-binding component  31.4 
 
 
229 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2302  ABC transporter related  30.24 
 
 
577 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  37.7 
 
 
247 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  34.16 
 
 
738 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4225  ABC transporter related  33.84 
 
 
384 aa  115  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00831393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2334  phosphate ABC transporter ATPase subunit  34.8 
 
 
268 aa  115  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1631  tungsten transporter, ATP binding protein  37.93 
 
 
243 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  34.72 
 
 
233 aa  115  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2950  ABC transporter related  31.34 
 
 
577 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.046002  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3259  toxin secretion ATP-binding protein  34.48 
 
 
723 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  30.69 
 
 
246 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  31.46 
 
 
230 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  33.68 
 
 
268 aa  114  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  34.2 
 
 
408 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  34.74 
 
 
552 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  35.38 
 
 
289 aa  114  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5945  ABC transporter related  32.99 
 
 
580 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152833  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2782  ABC transporter related  35.2 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.547592  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2396  ABC transporter related  33.33 
 
 
337 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0198  ABC transporter related  37.16 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.884369 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  35.29 
 
 
233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  30.84 
 
 
592 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1316  type I secretion system ATPase  33 
 
 
723 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0437  ABC transporter related protein  36.08 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08631  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  34.4 
 
 
270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.296362  hitchhiker  0.00137214 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2453  ABC transporter related  36.51 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000726379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  36.02 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  32.82 
 
 
455 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1304  ABC transporter related  33.33 
 
 
617 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5550  glutamine ABC transporter  37.44 
 
 
507 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.488891  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1452  aliphatic sulfonates transport ATP-binding subunit  34.95 
 
 
256 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>