More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1096 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1096  ABC transporter related  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0596237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5080  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5078  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4759  ABC transporter related  36.82 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4672  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 		 219 aa  138  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0162  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 219 aa  137  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5083  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 219 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5049  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4652  ABC transporter, ATP-binding protein  35.82 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4810  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5175  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0730  ABC transporter related  36.82 
 
 		 206 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0754  ABC transporter related  36.82 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000176191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1140  ABC transporter related  36.32 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15620  ABC transporter related  34.67 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  37.3 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2008  ABC-type transport system, ATPase component  29 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00806638  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1142  ABC transporter related  30.05 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1306  ABC transporter related  30.66 
 
 		 276 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  33.52 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  33.01 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2223  ABC transporter related  31.73 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.36 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2125  ABC transporter related  31.1 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0179374  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.37 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4084  ABC transporter related  31.38 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  35.59 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1805  ABC transporter related  32.22 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4399  ABC transporter related  29.95 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.224888 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  33.5 
 
 		 715 aa  99.8  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07251  putative phosphonate ABC transporter  34.23 
 
 		 246 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1468  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 257 aa  99  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 526 aa  99  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  31.07 
 
 		 222 aa  99  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4047  ABC transporter related  30.85 
 
 		 231 aa  99  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0086  ABC transporter related  27.23 
 
 		 255 aa  98.2  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  31.09 
 
 		 237 aa  97.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  34.23 
 
 		 246 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0213  ABC transporter related  33.33 
 
 		 214 aa  97.1  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  29.25 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2629  ABC transporter-related protein  31.47 
 
 		 337 aa  96.7  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  34 
 
 		 976 aa  97.1  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  36.07 
 
 		 225 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2860  ABC transporter related  29.38 
 
 		 255 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.019123  normal  0.0516236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 		 240 aa  95.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2286  ABC transporter related  30.1 
 
 		 258 aa  95.1  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0145591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  34.21 
 
 		 226 aa  95.1  6e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1972  ABC transporter ATP-binding protein  31.68 
 
 		 247 aa  95.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0305  ABC transporter related protein  29.8 
 
 		 283 aa  95.1  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  32.06 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3404  ABC transporter related  29.05 
 
 		 334 aa  94  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14490  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.85 
 
 		 548 aa  94  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1710  ABC transporter related  34.36 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.06 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.06 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  32.06 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.15 
 
 		 336 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  32.06 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.06 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  31.96 
 
 		 254 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3031  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 261 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.06 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  33.01 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  32.06 
 
 		 225 aa  93.6  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  32.64 
 
 		 270 aa  92.8  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2790  ABC transporter-like protein protein  28.77 
 
 		 260 aa  92.8  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3426  ABC transporter-related protein  28.8 
 
 		 267 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.175923 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  30.48 
 
 		 357 aa  92.8  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1516  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.88 
 
 		 383 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000189074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1540  ABC transporter related  29.65 
 
 		 244 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00440464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.18 
 
 		 562 aa  93.2  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0781  iron(III) dicitrate transport permease-like protein yusV  32.14 
 
 		 258 aa  92.8  3e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.215395  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0308  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 		 279 aa  92.8  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0672  iron-enterobactin transporter ATP-binding protein  28.8 
 
 		 271 aa  92.8  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  33.85 
 
 		 743 aa  92.8  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1250  methionine import ATP-binding protein MetN  32.29 
 
 		 318 aa  92.8  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  32.84 
 
 		 584 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  33 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  33.02 
 
 		 243 aa  92.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.31 
 
 		 582 aa  92.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  32.12 
 
 		 376 aa  92.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06010  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  31.82 
 
 		 254 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0150  ferrichrome transport ATP-binding protein FhuC  32.51 
 
 		 255 aa  92.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  31.82 
 
 		 245 aa  92.4  4e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.63 
 
 		 345 aa  92  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  32.31 
 
 		 246 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18750  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  30.53 
 
 		 298 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.371793 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 		 562 aa  92  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3014  ABC transporter related  29.03 
 
 		 252 aa  92  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.101758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  32.31 
 
 		 246 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.51 
 
 		 395 aa  91.7  6e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0140  ABC transporter related  26.77 
 
 		 275 aa  91.7  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0083  ABC transporter related  32.09 
 
 		 255 aa  91.7  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  31.13 
 
 		 741 aa  92  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  33.17 
 
 		 598 aa  91.7  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1126  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 367 aa  92  6e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.14 
 
 		 357 aa  91.7  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.84 
 
 		 597 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3672  ABC transporter related  32.43 
 
 		 533 aa  91.7  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>