More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0649 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_0649  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  649    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.174613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  97.8 
 
 		 351 aa  639    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0301  regulatory protein GntR HTH  42.5 
 
 		 353 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.814124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  33.23 
 
 		 364 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 359 aa  173  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2901  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  29.97 
 
 		 375 aa  156  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2905  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  29.97 
 
 		 372 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.532427  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0485  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00291499  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0226  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 362 aa  149  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  29.5 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  31.13 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.32 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  31.18 
 
 		 333 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  28.53 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  27.76 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  29.34 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  32.87 
 
 		 336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0131  transcriptional regulator, LacI family  30.56 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0129  transcriptional regulator, LacI family  30.03 
 
 		 332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4479  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 		 342 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.277487  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3846  transcriptional regulator, LacI family  29.57 
 
 		 348 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00500845  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3324  LacI family transcription regulator  30 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370251  normal  0.267565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1756  transcriptional regulator, LacI family  28.27 
 
 		 357 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  29.01 
 
 		 337 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0975  transcriptional regulator, LacI family  29.19 
 
 		 338 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  28.98 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  28.75 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  27.24 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0329  LacI family transcription regulator  28.24 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16025  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2249  LacI family transcription regulator  29.03 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00326004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2330  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0241905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2293  LacI family transcription regulator  29.03 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119214  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2509  transcriptional regulator  29.03 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2524  transcriptional regulator/sugar-binding domain, LacI family  29.03 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304303 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  28.97 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4388  LacI family transcription regulator  27.62 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4475  LacI family transcription regulator  27.62 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4769  LacI family transcription regulator  27.62 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  29.86 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  25.94 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.5 
 
 		 335 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0802  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.96 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0297  degradation activator  28.83 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0303599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0343  LacI family transcription regulator  28.22 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0241073  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  29.47 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  28.38 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000181496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  28.79 
 
 		 339 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  27.56 
 
 		 333 aa  106  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  29.23 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0052  LacI family transcription regulator  31.1 
 
 		 364 aa  105  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0956  transcriptional regulator, LacI family  29.03 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3308  LacI family transcription regulator  26.57 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.64 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.9 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  27.4 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.12 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  26.88 
 
 		 346 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2175  transcriptional regulator, LacI family  30.53 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.408939  normal  0.717598 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  27.21 
 
 		 340 aa  103  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.12 
 
 		 342 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.18 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  27.85 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  32.38 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  27.53 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  29.84 
 
 		 332 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0292  transcriptional regulator, LacI family  28.28 
 
 		 336 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  30.96 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3283  transcriptional regulator, LacI family  26.46 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  26.3 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0825  transcriptional regulator, LacI family  30.43 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3109  transcriptional regulator, LacI family  27.62 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2782  transcriptional regulator, LacI family  28.12 
 
 		 338 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 346 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  27.18 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  28.27 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0880  transcriptional regulator, LacI family  27.11 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  28.38 
 
 		 340 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4344  LacI family transcription regulator  26.27 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3162  transcriptional regulator, LacI family  28.11 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1125  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 		 341 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2601  transcriptional regulator, LacI family  27.03 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2904  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.87 
 
 		 339 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2388  DNA-binding transcriptional repressor PurR  28.3 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.282493  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0285  alanine racemase  28.48 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  27.61 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2073  LacI family transcription regulator  26.27 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05790  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.56 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4415  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3715  transcriptional regulator, LacI family  28.67 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000372976 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  27.37 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  28.62 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0892  LacI family transcription regulator  28.07 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 346 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2163  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.130175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0197  LacI family transcription regulator  26.12 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  27.53 
 
 		 340 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2742  DNA-binding transcriptional regulator CytR  26.62 
 
 		 335 aa  100  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>