More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0610 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  251  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  67.21 
 
 		 126 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  63.93 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  62.81 
 
 		 126 aa  168  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  61.98 
 
 		 124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  62.81 
 
 		 124 aa  161  3e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  60.33 
 
 		 126 aa  159  9e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 		 143 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  56.2 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  52.46 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 125 aa  143  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  54.92 
 
 		 124 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  52.42 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2398  putative endoribonuclease L-PSP  49.19 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000108439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  52.8 
 
 		 126 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  52 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0174  endoribonuclease L-PSP  51.24 
 
 		 125 aa  137  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.282996 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2324  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 125 aa  136  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  6.85805e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 140 aa  136  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2235  endoribonuclease L-PSP, putative  52.89 
 
 		 126 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00087243  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  51.61 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  51.61 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  54.7 
 
 		 124 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 126 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  53.72 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1694  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  51.67 
 
 		 126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  54.03 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  48.78 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 123 aa  130  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  48.36 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0733  endoribonuclease L-PSP  56.41 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  50.82 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  56.41 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0387  endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000500244 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  50.81 
 
 		 125 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  51.28 
 
 		 125 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1033  putative endoribonuclease L-PSP  54.62 
 
 		 124 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  52.46 
 
 		 125 aa  127  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  48.39 
 
 		 127 aa  127  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  51.22 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  47.5 
 
 		 126 aa  125  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  43.55 
 
 		 126 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  46.34 
 
 		 123 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  54.17 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4587  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 126 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0508  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000880426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0493  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  46.77 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  53.1 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1493  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 124 aa  124  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  45.97 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0542  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  123  7e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0603  endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.35425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1054  putative endoribonuclease L-PSP  47.11 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0726433  normal  0.0135345 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  51.33 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  123  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  44.72 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  50 
 
 		 124 aa  122  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1404  endoribonuclease L-PSP, putative  45.97 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  50.41 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5540  endoribonuclease L-PSP  47.93 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00356179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02784  hypothetical protein  46.72 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  49.18 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  49.18 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  49.18 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1134  endoribonuclease L-PSP  47.58 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  47.54 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1312  putative endoribonuclease L-PSP  47.97 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  47.41 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0106  endoribonuclease L-PSP  49.59 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  44.72 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  50.44 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0972  YjgF-like protein  48.82 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00459079  normal  0.578034 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0176  endoribonuclease L-PSP  45.9 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0812936  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3159  putative endoribonuclease L-PSP  53.23 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000982844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  49.18 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  48.33 
 
 		 129 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  51.24 
 
 		 135 aa  121  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0868  YjgF family translation initiation inhibitor  48.74 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000281222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1824  YjgF-like protein  45.67 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.516822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  45.16 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0664  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  43.9 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1300  YjgF-like protein  46.28 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00325157  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2387  endoribonuclease L-PSP  49.15 
 
 		 124 aa  120  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0877  YjgF-like protein  45.53 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3444  putative endoribonuclease L-PSP  46.28 
 
 		 129 aa  120  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00474727  decreased coverage  0.0000224932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>