More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0516 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0516  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 
372 aa  742    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.21 
 
 
379 aa  258  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  40.59 
 
 
382 aa  258  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.61 
 
 
382 aa  256  5e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.98 
 
 
382 aa  250  3e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  41.07 
 
 
377 aa  247  2e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.93 
 
 
360 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  39.29 
 
 
388 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  37.1 
 
 
362 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.29 
 
 
362 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.01 
 
 
368 aa  223  6e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.63 
 
 
388 aa  221  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  37.81 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.86 
 
 
382 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.84 
 
 
379 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.04 
 
 
387 aa  218  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.1 
 
 
362 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.34 
 
 
375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.25 
 
 
386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5980  succinyl-CoA synthetase subunit beta  38.74 
 
 
388 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0440177  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.92 
 
 
387 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.16 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.03 
 
 
379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.25 
 
 
386 aa  216  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.04 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.93 
 
 
378 aa  215  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4870  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.91 
 
 
387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.06 
 
 
393 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.74 
 
 
389 aa  212  7e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.59 
 
 
400 aa  212  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.01 
 
 
385 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1367  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.37 
 
 
378 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.09 
 
 
387 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.79 
 
 
393 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.68 
 
 
381 aa  209  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.96 
 
 
396 aa  209  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.71 
 
 
389 aa  208  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3999  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.01 
 
 
411 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00455857  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6508  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.47 
 
 
389 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.04 
 
 
382 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.48 
 
 
382 aa  207  3e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.03 
 
 
382 aa  207  3e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28160  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  36.26 
 
 
390 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2537  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.51 
 
 
393 aa  206  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.46 
 
 
384 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.02 
 
 
389 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.36 
 
 
383 aa  205  9e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07730  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.04 
 
 
394 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200324  normal  0.6485 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  35.37 
 
 
389 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.59 
 
 
381 aa  203  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4707  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.26 
 
 
387 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4327  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.26 
 
 
387 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.42 
 
 
384 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4413  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.26 
 
 
387 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284627  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  35.14 
 
 
393 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.78 
 
 
387 aa  203  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0841  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.85 
 
 
361 aa  202  8e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.67 
 
 
395 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3017  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.71 
 
 
395 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0271447  normal  0.0121594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  35.42 
 
 
388 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1341  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.26 
 
 
387 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.171512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.42 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0247  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.15 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  35.87 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.16 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.96 
 
 
392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0425  succinyl-CoA synthase, beta subunit  33.88 
 
 
387 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0380  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.27 
 
 
392 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0587  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.88 
 
 
387 aa  200  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  35.19 
 
 
395 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.77 
 
 
391 aa  199  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.54 
 
 
387 aa  199  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.16 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3311  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.99 
 
 
387 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  38.1 
 
 
383 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.31 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0074  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.77 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.698704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.76 
 
 
388 aa  197  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.59 
 
 
387 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.74 
 
 
385 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2797  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.51 
 
 
388 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.646018  normal  0.685585 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.68 
 
 
392 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.15 
 
 
387 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1988  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.97 
 
 
401 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.03 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  35.98 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1716  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.33 
 
 
394 aa  196  5.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0095  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.26 
 
 
359 aa  196  6e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.44 
 
 
392 aa  196  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.49 
 
 
388 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.49 
 
 
388 aa  196  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.69 
 
 
382 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.77 
 
 
391 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.29 
 
 
390 aa  195  1e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
386 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
389 aa  194  2e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2491  malate--CoA ligase subunit beta  35.15 
 
 
392 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.96 
 
 
387 aa  194  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  35.09 
 
 
389 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>