221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3962 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  100 
 
 		 118 aa  220  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  44.54 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  42.02 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0525  Camphor resistance CrcB protein  48.33 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.82 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  38.39 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  36.84 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.13 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1344  Integral membrane protein for chromosome condensation  32 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  43.68 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.68 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  41 
 
 		 114 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.66 
 
 		 126 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  32.67 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  34.19 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  41.41 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  36.75 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1527  Camphor resistance CrcB protein  35.59 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  37.27 
 
 		 121 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  30 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  36.75 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  37.74 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  37.82 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  39.17 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  36 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.3 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  41.3 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1283  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 120 aa  57  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000139326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  39.32 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  33.94 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  39.33 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  46.15 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  40.23 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  36.96 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  39.58 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  34.44 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  40.86 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  40.91 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  36.36 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  30.51 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  37.38 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  41.38 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  38.78 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  30.43 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  37.11 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  32.48 
 
 		 270 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 127 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  30.51 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0201  camphor resistance CrcB protein  29.41 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  34.34 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  35.34 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  30.25 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  36.75 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  37.36 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  37.5 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1339  CrcB family protein  34.17 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0192605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  32.43 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 		 170 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.78 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.78 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  38.14 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  33.91 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0455  Camphor resistance CrcB protein  39.33 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.592746  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  37.36 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  37.78 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  37.36 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  46.51 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  35.63 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  32.22 
 
 		 122 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  40.37 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  33.33 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  37.36 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  36.17 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  37.36 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  35.58 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>