More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2893 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2893  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 309 aa  611  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2735  Helix-turn-helix, AraC domain protein  59.49 
 
 		 310 aa  346  3e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0988  transcriptional regulator, AraC family  55.07 
 
 		 310 aa  295  6e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0224549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2203  Helix-turn-helix, AraC domain protein  54.61 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263082  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0432  helix-turn-helix domain-containing protein  45.54 
 
 		 307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0214  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0224  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0236  helix-turn-helix domain-containing protein  44.95 
 
 		 351 aa  215  7e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0204  AraC family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2438  Helix-turn-helix, AraC domain protein  35.11 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170886  normal  0.130727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  43.51 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  44.66 
 
 		 329 aa  68.9  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  42.27 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  38.71 
 
 		 147 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  34.58 
 
 		 288 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  41.25 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 325 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03191  transcription regulator protein  40 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  38.75 
 
 		 265 aa  53.5  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 288 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 270 aa  53.1  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  36.36 
 
 		 288 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  35.96 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.55 
 
 		 1396 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3181  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 155 aa  51.6  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0784  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.620589  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  35.25 
 
 		 150 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  35.35 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  35.35 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 147 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 279 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 145 aa  50.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 285 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 134 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 154 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 143 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 148 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 287 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1398  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 296 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.584508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 147 aa  50.1  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32460  transciption regulator, AraC-family  33.66 
 
 		 269 aa  49.7  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 324 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1632  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.653877  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  37.5 
 
 		 141 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3543  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  33.75 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0733434 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 300 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.89 
 
 		 164 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0371  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 156 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 147 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 147 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0071  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 288 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 436 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1861  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.301297 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 300 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 151 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1490  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 197 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107689  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 281 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54010  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 145 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5835  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.376008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  37.38 
 
 		 144 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2272  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.821113  normal  0.340779 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4887  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 278 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0694091  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4197  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.973971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>