164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2103 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2103  SNARE associated Golgi protein-related protein  100 
 
 		 229 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2418  SNARE associated Golgi protein-like protein  52.26 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.934082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  49.27 
 
 		 267 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  48.78 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  45.74 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  45.74 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  45.74 
 
 		 255 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  48.04 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  38.24 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  30.41 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  37.5 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  34.67 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  31.21 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  31.21 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  33.74 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  33.55 
 
 		 174 aa  72  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  24.77 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  24.77 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  24.77 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  34.36 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  30.82 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  24.77 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  34.08 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  24.32 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  34.25 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  31.55 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  24.32 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  24.32 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  24.32 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  35.82 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22210  hypothetical protein  32.61 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  25.13 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  26.7 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  32.37 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1944  SNARE associated Golgi protein  30.69 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0795121  normal  0.25437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  33.12 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  29.55 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  23.42 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.12 
 
 		 738 aa  62.4  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  29.01 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.11 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  32.4 
 
 		 235 aa  62  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  29.38 
 
 		 714 aa  61.6  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2222  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.67 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  30.86 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  25.4 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  32.14 
 
 		 623 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0083  SNARE associated Golgi protein  33.1 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.95 
 
 		 722 aa  60.5  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  32.09 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  34.01 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  30.17 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.63 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  30.77 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.29 
 
 		 722 aa  58.9  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  32.37 
 
 		 722 aa  58.9  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  29.38 
 
 		 714 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  29.82 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  28.22 
 
 		 714 aa  57  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  30.16 
 
 		 714 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.46 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4133  SNARE associated Golgi protein  27.88 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.341541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2048  SNARE associated Golgi protein  30.29 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4094  SNARE associated Golgi protein  27.88 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  32.35 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.24 
 
 		 713 aa  56.6  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2345  hypothetical protein  28.24 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  29.85 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  32.7 
 
 		 716 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  29.03 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  25.34 
 
 		 720 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0659  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.89 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0859384 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  28.67 
 
 		 714 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  28.39 
 
 		 717 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  30.5 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.92 
 
 		 717 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  31.1 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1326  hypothetical protein  31.25 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0497167  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.62 
 
 		 717 aa  52.4  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  27.33 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3384  hypothetical protein  28.47 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  29.52 
 
 		 738 aa  52  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  28.85 
 
 		 803 aa  51.2  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  31.65 
 
 		 265 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.97 
 
 		 746 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  24.84 
 
 		 304 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4825  SNARE associated Golgi protein-like protein  27.14 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2261  SNARE associated Golgi protein  23.73 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000842977  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  29.45 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  30.59 
 
 		 732 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  30.59 
 
 		 732 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2726  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0192571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1515  SNARE associated Golgi protein  28.82 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.12103 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  27.27 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0543  DedA family protein  27.27 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  27.45 
 
 		 266 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  25.97 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01579  hypothetical protein  27.47 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>