185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1588 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1588  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 		 385 aa  789    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4240  DNA-cytosine methyltransferase  50.42 
 
 		 387 aa  349  5e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481849  normal  0.893444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0452  DNA-cytosine methyltransferase  39.37 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0206606  hitchhiker  0.00155723 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4756  DNA-cytosine methyltransferase  38.13 
 
 		 375 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1810  C-5 cytosine-specific DNA methylase  36.1 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1337  DNA-cytosine methyltransferase  33.6 
 
 		 393 aa  170  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.911958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1389  DNA-cytosine methyltransferase  33.42 
 
 		 387 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1470  DNA-cytosine methyltransferase  30.13 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0547  DNA-cytosine methyltransferase  34.02 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4109  DNA-cytosine methyltransferase  31.43 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.560504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2261  DNA-cytosine methyltransferase  31.25 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  23.53 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  35.33 
 
 		 315 aa  97.4  4e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  31.35 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  22.84 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.74 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  30.73 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  25.07 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1855  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  35.83 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.918584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  23.64 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  31.18 
 
 		 328 aa  83.2  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  26.95 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  31.64 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001833  DNA-cytosine methyltransferase  32.14 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  23.31 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  28.49 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  27.91 
 
 		 727 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.81 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47357  predicted protein  30.54 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.22131  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  25.13 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  25.59 
 
 		 406 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  24.42 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  24.8 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.84 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  24.08 
 
 		 338 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  31.76 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  30.54 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  27 
 
 		 416 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  25.41 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  23.59 
 
 		 329 aa  72.8  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1962  DNA-cytosine methyltransferase  28.81 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0166825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  25.73 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0352  DNA-cytosine methyltransferase  30.77 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  30 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1728  DNA-cytosine methyltransferase  33.33 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.770689  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  21.27 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0058  phage-related DNA methylase, N-terminal region  30.86 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1017  DNA-cytosine methyltransferase  29.12 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000173246  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  25.54 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  23.43 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  24.26 
 
 		 324 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1972  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0825702  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  26.87 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  28.24 
 
 		 327 aa  66.6  0.0000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  27.96 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl308  modification methylase Sau3AI (GATC cytosine-specific methyltransferase)  28.57 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00656674  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0472  DNA-cytosine methyltransferase  29.67 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  24.71 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  28.74 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  30.43 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  26.87 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.88 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0061  C-5 cytosine-specific DNA methylase  32.26 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.346771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  28.21 
 
 		 460 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  25.9 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  29.47 
 
 		 447 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  25.77 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  29.7 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  28.74 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  29.7 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  29.7 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  29.7 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  23.87 
 
 		 352 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  29.7 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  29.7 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  26.79 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  29.7 
 
 		 472 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  25.21 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  28.41 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 		 318 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl304  deoxycytosine methylase  31.34 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.2985e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  35 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  27.05 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  24.86 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2841  DNA-cytosine methyltransferase  27.27 
 
 		 719 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0756  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.967927  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  26.44 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1359  site-specific DNA methylase  28.79 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000354899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  31.09 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>