More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1364 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  62.66 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  62.66 
 
 		 243 aa  301  6.000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  58.92 
 
 		 247 aa  281  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  53.94 
 
 		 242 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  53.53 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  53.75 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  52.99 
 
 		 255 aa  241  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  53.31 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  54.96 
 
 		 245 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  53.69 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  51.82 
 
 		 247 aa  218  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 246 aa  212  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  47.7 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  47.28 
 
 		 259 aa  207  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  44.21 
 
 		 246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  47.11 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 243 aa  149  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  33.76 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  40.09 
 
 		 246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  34.91 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  37.78 
 
 		 250 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  39.21 
 
 		 244 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3544  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0513  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0447  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.567966  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  34.19 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 286 aa  112  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2475  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.02 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  30.09 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04320  transcriptional regulator GntR family  36.65 
 
 		 240 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  30.43 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1007  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.497463  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15830  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.800651  normal  0.0246518 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  34.35 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  34.51 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 233 aa  106  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 240 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 240 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0426  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  31.72 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2416  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.47741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2626  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000663973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8112  transcriptional regulator, GntR family  37.83 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0801  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.912886  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  34.96 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05542  putative DNA-binding transcriptional regulatory transcription regulator protein  30.84 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0364359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 244 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1647  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 251 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5635  transcriptional regulator, GntR family  31.62 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  0.0151666 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  34.62 
 
 		 263 aa  101  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  32.75 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1361  putative transcriptional regulator  31.88 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>