More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1793 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1793  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
320 aa  609  1e-173  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.096157  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0328  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  82.5 
 
 
320 aa  494  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2275  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  76.75 
 
 
323 aa  432  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0754968  normal  0.291328 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2048  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  74.92 
 
 
324 aa  423  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110372 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0303  NADH dehydrogenase subunit H  40.58 
 
 
361 aa  245  6.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.594505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1301  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  39.22 
 
 
352 aa  219  6e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1633  NADH dehydrogenase subunit H  41.72 
 
 
350 aa  212  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0658  NADH dehydrogenase subunit H  42.9 
 
 
349 aa  209  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0515  NADH dehydrogenase subunit H  43.45 
 
 
341 aa  206  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1898  NADH dehydrogenase subunit H  35.71 
 
 
352 aa  206  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180885  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1082  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  41.46 
 
 
337 aa  192  7e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.524281  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0646  NADH dehydrogenase subunit H  40.51 
 
 
343 aa  187  3e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.411826  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.45 
 
 
329 aa  159  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.11 
 
 
349 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 
344 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.98 
 
 
343 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  31.16 
 
 
432 aa  149  5e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  34.43 
 
 
349 aa  149  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3614  NADH dehydrogenase (quinone)  34.01 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  34.1 
 
 
349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2714  NADH dehydrogenase subunit H  33.22 
 
 
372 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.834243  normal  0.483082 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  35.1 
 
 
353 aa  147  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  32.42 
 
 
372 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  34.65 
 
 
353 aa  146  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  31.82 
 
 
372 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  33.78 
 
 
341 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  33.78 
 
 
341 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 
451 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0402  NADH dehydrogenase  32.25 
 
 
372 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  33.33 
 
 
384 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  31.51 
 
 
372 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0162  NADH dehydrogenase subunit H  32.25 
 
 
372 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01801  NADH dehydrogenase subunit H  32.25 
 
 
372 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.624846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  33.68 
 
 
333 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  32.34 
 
 
348 aa  143  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01781  NADH dehydrogenase subunit H  32.25 
 
 
372 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.236332  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  32.03 
 
 
384 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  34.55 
 
 
372 aa  143  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  34.75 
 
 
353 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33 
 
 
337 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.44 
 
 
348 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  31.61 
 
 
372 aa  142  9e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  31.7 
 
 
372 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4411  NADH dehydrogenase (quinone)  31.65 
 
 
438 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  33.55 
 
 
372 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2050  NADH dehydrogenase (quinone)  34.52 
 
 
341 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  32.58 
 
 
372 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  32.58 
 
 
372 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.53 
 
 
354 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4488  NADH dehydrogenase subunit H  34.17 
 
 
410 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0439887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  33.22 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4081  NADH dehydrogenase (quinone)  30.67 
 
 
359 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.699497  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6675  NADH dehydrogenase subunit H  32.62 
 
 
447 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  31.4 
 
 
333 aa  139  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.15 
 
 
344 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3408  F420H2 dehydrogenase subunit H  32.63 
 
 
346 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00645372  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 
341 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3088  NADH dehydrogenase (quinone)  34.28 
 
 
357 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1239  NADH dehydrogenase (quinone)  32.57 
 
 
350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  30.39 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3819  NADH dehydrogenase (quinone)  34.83 
 
 
318 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0527  NADH dehydrogenase subunit H  31.31 
 
 
449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1878  NADH dehydrogenase subunit H  33.76 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349775  normal  0.979867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4237  NADH dehydrogenase (quinone)  31.94 
 
 
349 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000514552  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2412  NADH dehydrogenase subunit H  31.54 
 
 
373 aa  136  5e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.33 
 
 
337 aa  136  5e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  31.78 
 
 
372 aa  135  7.000000000000001e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  31.48 
 
 
340 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.94 
 
 
366 aa  135  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3175  NADH dehydrogenase (quinone)  33.98 
 
 
430 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.616165  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3864  NADH dehydrogenase (quinone)  31.4 
 
 
390 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0280  NADH dehydrogenase subunit H  31.88 
 
 
373 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  31.47 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1998  NADH dehydrogenase subunit H  33.89 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222188  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3388  NADH dehydrogenase (quinone)  33.13 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2236  NADH dehydrogenase (quinone)  33.13 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249199  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  31.85 
 
 
340 aa  133  3e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  34.72 
 
 
330 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02167  hypothetical protein  32.16 
 
 
327 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1630  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.1 
 
 
331 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1543  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 
416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.671965  normal  0.0902483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1573  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 
416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1597  NADH dehydrogenase subunit H  32.59 
 
 
416 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824688  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02207  NADH dehydrogenase subunit H  31.89 
 
 
325 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  31.89 
 
 
325 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0103181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2575  NADH dehydrogenase subunit H  31.89 
 
 
325 aa  133  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2431  NADH dehydrogenase subunit H  31.89 
 
 
325 aa  133  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1370  NADH dehydrogenase subunit H  31.89 
 
 
325 aa  133  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.638509  normal  0.284732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2436  NADH dehydrogenase subunit H  31.89 
 
 
325 aa  133  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3421  NADH dehydrogenase subunit H  31.89 
 
 
325 aa  133  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.950674  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>