38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2457 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2457  hypothetical protein  100 
 
 
326 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.379583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1174  hypothetical protein  49.66 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1675  hypothetical protein  45.45 
 
 
278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0305  hypothetical protein  38.31 
 
 
314 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4166  hypothetical protein  41.63 
 
 
316 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.237065  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2748  hypothetical protein  43.02 
 
 
316 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0536  hypothetical protein  33.56 
 
 
349 aa  102  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1073  hypothetical protein  33.83 
 
 
330 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179281  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2749  hypothetical protein  35.77 
 
 
353 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000208383  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1301  hypothetical protein  32.68 
 
 
350 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0318  hypothetical protein  38.33 
 
 
343 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2560  hypothetical protein  40.16 
 
 
312 aa  92.8  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4222  hypothetical protein  30.5 
 
 
313 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5623  hypothetical protein  29.02 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0083696  normal  0.628731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4504  hypothetical protein  29.11 
 
 
319 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  24.82 
 
 
302 aa  77  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0745  hypothetical protein  30.25 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0577  hypothetical protein  29.75 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.112901  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0731  hypothetical protein  29.48 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000108123 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2879  hypothetical protein  31.07 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5600  hypothetical protein  28.88 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0688  hypothetical protein  23.93 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.700427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4413  hypothetical protein  21.51 
 
 
326 aa  59.3  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00830012  normal  0.663771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1606  hypothetical protein  37.63 
 
 
319 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0634  hypothetical protein  25.3 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1682  hypothetical protein  50.94 
 
 
248 aa  58.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0604  hypothetical protein  22.39 
 
 
295 aa  53.1  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0463  hypothetical protein  24.75 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2204  hypothetical protein  25.95 
 
 
297 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0412  hypothetical protein  34.38 
 
 
309 aa  45.8  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0404  hypothetical protein  35.25 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1410  hypothetical protein  38.89 
 
 
347 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.92034  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1672  hypothetical protein  24.24 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000269859  normal  0.37402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2638  hypothetical protein  28.8 
 
 
324 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.898598  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3771  hypothetical protein  31.52 
 
 
289 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.720928  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0549  hypothetical protein  37.04 
 
 
347 aa  43.9  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00564002  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2886  integral membrane protein  27.97 
 
 
322 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.588133  normal  0.167776 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1794  hypothetical protein  22.88 
 
 
319 aa  42.7  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.51439  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>