73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2083 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 		 222 aa  455  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6445  anti-ECFsigma factor, ChrR  68.54 
 
 		 244 aa  295  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6152  anti-ECFsigma factor, ChrR  66.67 
 
 		 222 aa  289  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0869  anti-sigm factor, ChrR  63.51 
 
 		 225 aa  288  4e-77  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1005  anti-ECFsigma factor, ChrR  65.14 
 
 		 222 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000085079 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0840  anti-sigma factor, ChrR  60.35 
 
 		 230 aa  278  4e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  59.07 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0881  hypothetical protein  64.89 
 
 		 192 aa  242  3e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0707525  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4157  anti-sigm factor, ChrR  51.36 
 
 		 219 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424525 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1969  anti-ECFsigma factor, ChrR  50.69 
 
 		 232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0423  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.67 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0586  anti-ECFsigma factor, ChrR  43.61 
 
 		 222 aa  176  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1793  transcriptional regulator  43.89 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376612  normal  0.0711079 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3840  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.19 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1782  anti-ECFsigma factor, ChrR  45.25 
 
 		 234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336195  normal  0.05616 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5392  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.04 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.19 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4129  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.73 
 
 		 235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1332  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.8 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.469882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  40.47 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1906  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.92 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  40.74 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.09 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.09 
 
 		 221 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3233  anti-ECFsigma factor, ChrR  43.52 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.09 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.09 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1225  anti-sigm factor, ChrR  41.59 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201902  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3618  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.89 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0730754  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.07 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0025  transcriptional activator anti-ECFsigma factor  42.47 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322497  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.5 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41079  predicted protein  40.61 
 
 		 243 aa  145  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1362  anti-ECFsigma factor, ChrR  40 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0852  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.89 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0982  hypothetical protein  37.61 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.5 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0821  hypothetical protein  37.21 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.85 
 
 		 236 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0451  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.47 
 
 		 241 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38082 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1946  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.15 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1968  anti-Sigm factor, ChrR  38.02 
 
 		 150 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.603561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4481  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.93 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6449  anti-ECFsigma factor, ChrR  43.48 
 
 		 117 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0335897 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5650  Allophanate hydrolase  41.18 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0555941  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03283  hypothetical protein  34.13 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2323  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.62 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.586398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0996  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.35 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.84209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.22 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2037  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.97 
 
 		 262 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.280175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2472  anti-sigm factor, ChrR  40.74 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.483016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2319  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.71 
 
 		 228 aa  47.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3257  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.38 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.442246  normal  0.111032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1454  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.14 
 
 		 125 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1985  transcriptional activator, putative  33.33 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1890  putative transcriptional activator  37.29 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.37 
 
 		 246 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3373  anti-sigma factor ChrR, putative  32.5 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  27.59 
 
 		 132 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002701  putative transcriptional activator ChrR  36.51 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2466  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.41 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2348  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.41 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.527033  normal  0.0659937 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1748  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0800571  hitchhiker  0.00180975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2712  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 243 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2598  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0659  hypothetical protein  32.5 
 
 		 123 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0490503  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0637  hypothetical protein  32.5 
 
 		 123 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1378  putative transcriptional activator  29.85 
 
 		 228 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.857298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1333  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0130181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2637  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 240 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7184  hypothetical protein  30.59 
 
 		 114 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00083375  normal  0.803143 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1477  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.26 
 
 		 249 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.688237  normal  0.852126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2276  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.41 
 
 		 231 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>