34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0659 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_0659  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0490503  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0637  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  258  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1689  hypothetical protein  65.81 
 
 
124 aa  172  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.266015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4364  hypothetical protein  35 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0376  hypothetical protein  35.71 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330779  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2409  hypothetical protein  35.65 
 
 
128 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4662  hypothetical protein  34.17 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.862507  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3820  hypothetical protein  34.78 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3701  hypothetical protein  34.17 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6312  hypothetical protein  32.74 
 
 
129 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1050  hypothetical protein  33.63 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0308195  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0821  hypothetical protein  41.67 
 
 
214 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  33.67 
 
 
218 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4975  cupin 2, barrel  36.36 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254232  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4294  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373315  normal  0.351729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3185  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2111  cupin 2 domain-containing protein  29.73 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.25 
 
 
239 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1225  anti-sigm factor, ChrR  33.78 
 
 
220 aa  42.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201902  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0881  hypothetical protein  32.5 
 
 
192 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0707525  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1005  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.9 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000085079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 
222 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.14 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.5 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0852  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.06 
 
 
214 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1969  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.77 
 
 
232 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3618  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.82 
 
 
212 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0730754  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.01 
 
 
236 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  32.14 
 
 
223 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.14 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 
220 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.14 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.14 
 
 
221 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4208  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.03 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0581273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>