19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1050 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1050  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  255  1e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0308195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6312  hypothetical protein  49.19 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0376  hypothetical protein  50 
 
 		 126 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2409  hypothetical protein  45.24 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4662  hypothetical protein  45.24 
 
 		 146 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.862507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3701  hypothetical protein  45.24 
 
 		 146 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3820  hypothetical protein  45.24 
 
 		 128 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4975  cupin 2, barrel  49.53 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254232  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3185  cupin 2 domain-containing protein  49.53 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4294  cupin 2 domain-containing protein  49.53 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373315  normal  0.351729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2111  cupin 2 domain-containing protein  44.14 
 
 		 115 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4364  hypothetical protein  42.2 
 
 		 116 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4208  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.11 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1689  hypothetical protein  35.45 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.266015  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0637  hypothetical protein  33.63 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0659  hypothetical protein  33.63 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0490503  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.43 
 
 		 220 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.08 
 
 		 222 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3502  hypothetical protein  33.33 
 
 		 254 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>