24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3185 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4294  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373315  normal  0.351729 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4975  cupin 2, barrel  100 
 
 		 129 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254232  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3185  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2111  cupin 2 domain-containing protein  50.43 
 
 		 115 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0376  hypothetical protein  46.3 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1050  hypothetical protein  49.53 
 
 		 124 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0308195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4662  hypothetical protein  42.59 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.862507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3701  hypothetical protein  42.59 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2409  hypothetical protein  42.59 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3820  hypothetical protein  42.59 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6312  hypothetical protein  39.84 
 
 		 129 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4364  hypothetical protein  38.18 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1689  hypothetical protein  33.64 
 
 		 124 aa  49.7  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.266015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0821  hypothetical protein  36.05 
 
 		 214 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0637  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0659  hypothetical protein  36.36 
 
 		 123 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0490503  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.22 
 
 		 222 aa  42.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0852  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.5 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3618  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.95 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0730754  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4208  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.57 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.93 
 
 		 220 aa  42.4  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1225  anti-sigm factor, ChrR  28.68 
 
 		 220 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3502  hypothetical protein  29.21 
 
 		 254 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  34.09 
 
 		 218 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>