59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3618 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3618  anti-ECFsigma factor, ChrR  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0730754  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  49.08 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0821  hypothetical protein  47.93 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  45.79 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  44.65 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  44.04 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0852  anti-ECFsigma factor, ChrR  45.58 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.413109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  43.72 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.79 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.79 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.79 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1362  anti-ECFsigma factor, ChrR  42.52 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1225  anti-sigm factor, ChrR  42.47 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00201902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1969  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.28 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4157  anti-sigm factor, ChrR  39.15 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.424525 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6445  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.72 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6152  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.25 
 
 		 222 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1906  anti-ECFsigma factor, ChrR  39.27 
 
 		 228 aa  148  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1005  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.89 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000085079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0423  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.19 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2083  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.89 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.246255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0586  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.32 
 
 		 222 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.35 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1793  transcriptional regulator  38.79 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376612  normal  0.0711079 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1946  anti-ECFsigma factor, ChrR  38.5 
 
 		 224 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00378013  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4129  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.48 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1782  anti-ECFsigma factor, ChrR  40.19 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336195  normal  0.05616 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0982  hypothetical protein  39.5 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5392  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.28 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  36.74 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0869  anti-sigm factor, ChrR  35.65 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0948086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0025  transcriptional activator anti-ECFsigma factor  39.55 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322497  normal  0.142099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3840  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.09 
 
 		 224 aa  132  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1373  anti-ECFsigma factor, ChrR  35.81 
 
 		 239 aa  131  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.86738  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0840  anti-sigma factor, ChrR  36.65 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.518055 
 
 
-
 
NC_003296  RS00891  hypothetical protein  36.57 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3233  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.33 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.741075  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0881  hypothetical protein  39.46 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0707525  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1332  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.95 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.469882 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0451  anti-ECFsigma factor, ChrR  29.44 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38082 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41079  predicted protein  34.6 
 
 		 243 aa  98.6  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1968  anti-Sigm factor, ChrR  38.71 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.603561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6449  anti-ECFsigma factor, ChrR  41.67 
 
 		 117 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0335897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3608  anti-Sigm factor, ChrR  33.33 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4481  anti-ECFsigma factor, ChrR  44.62 
 
 		 117 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5650  Allophanate hydrolase  41.54 
 
 		 114 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0555941  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6860  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.08 
 
 		 136 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2037  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.52 
 
 		 262 aa  45.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.280175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4294  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 129 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373315  normal  0.351729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4076  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.1 
 
 		 231 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4975  cupin 2, barrel  30.95 
 
 		 129 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254232  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3185  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 129 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2779  anti-ECFsigma factor, ChrR  30.34 
 
 		 246 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.960019 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4662  hypothetical protein  34.57 
 
 		 146 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.862507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3701  hypothetical protein  34.57 
 
 		 146 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0637  hypothetical protein  31.82 
 
 		 123 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3820  hypothetical protein  34.57 
 
 		 128 aa  41.6  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0659  hypothetical protein  31.82 
 
 		 123 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0490503  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4364  hypothetical protein  32.08 
 
 		 116 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>