23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2409 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2409  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  267  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4662  hypothetical protein  98.44 
 
 
146 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.862507  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3701  hypothetical protein  98.44 
 
 
146 aa  265  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3820  hypothetical protein  98.44 
 
 
128 aa  264  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0376  hypothetical protein  67.97 
 
 
126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330779  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6312  hypothetical protein  65.08 
 
 
129 aa  169  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1050  hypothetical protein  45.24 
 
 
124 aa  111  3e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0308195  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4975  cupin 2, barrel  42.59 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254232  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3185  cupin 2 domain-containing protein  42.59 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4294  cupin 2 domain-containing protein  42.59 
 
 
129 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373315  normal  0.351729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2111  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4364  hypothetical protein  34.91 
 
 
116 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0637  hypothetical protein  35.65 
 
 
123 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0659  hypothetical protein  35.65 
 
 
123 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0490503  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  30.83 
 
 
218 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1689  hypothetical protein  35.87 
 
 
124 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.266015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.37 
 
 
222 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4208  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
124 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  28.91 
 
 
221 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.78 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  27.78 
 
 
221 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1495  anti-ECFsigma factor, ChrR  31.71 
 
 
222 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3618  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.93 
 
 
212 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0730754  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>