26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4208 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4208  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0581273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4364  hypothetical protein  43.27 
 
 		 116 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6312  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1050  hypothetical protein  37.11 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0308195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0376  hypothetical protein  31.68 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1575  anti-ECFsigma factor, ChrR  37.08 
 
 		 220 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0893  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.71 
 
 		 221 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000607  hypothetical protein  36.14 
 
 		 223 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000379555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3481  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.71 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0858  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.71 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0881  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.71 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1180  anti-ECFsigma factor, ChrR  40 
 
 		 222 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3701  hypothetical protein  39.34 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4662  hypothetical protein  39.34 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.862507  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2409  hypothetical protein  39.34 
 
 		 128 aa  43.5  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3820  hypothetical protein  39.34 
 
 		 128 aa  43.5  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal  0.759968 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4247  anti-ECFsigma factor, ChrR  34.83 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.364362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02219  predicted transcription negative regulator  34.52 
 
 		 218 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.279228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1689  hypothetical protein  31.71 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.266015  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4975  cupin 2, barrel  40.85 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254232  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0659  hypothetical protein  27.78 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0490503  normal  0.219182 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0637  hypothetical protein  27.78 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4294  cupin 2 domain-containing protein  40.85 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.373315  normal  0.351729 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3185  cupin 2 domain-containing protein  40.85 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0821  hypothetical protein  37.36 
 
 		 214 aa  41.6  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1906  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.71 
 
 		 228 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.150648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>