More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1870 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1870  succinate--CoA ligase (ADP-forming)  100 
 
 
338 aa  679    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00455189  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1378  succinate--CoA ligase (ADP-forming)  44.29 
 
 
355 aa  278  7e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00172923  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2396  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  40.33 
 
 
375 aa  246  3e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000351393  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0043  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  42.98 
 
 
360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1562  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  39.32 
 
 
362 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0289  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.54 
 
 
382 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0479  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  38.46 
 
 
362 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1529  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.84 
 
 
382 aa  229  5e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.36808  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0357  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.46 
 
 
362 aa  229  5e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0021079 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0430  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.85 
 
 
362 aa  227  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.147024  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1657  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.11 
 
 
382 aa  226  4e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.231909 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0986  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  36.29 
 
 
368 aa  226  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000000927253  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1026  succinyl-CoA synthetase subunit beta  37.43 
 
 
382 aa  222  7e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000227763  unclonable  8.1657e-23 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0487  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  37.47 
 
 
361 aa  222  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1463  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.07 
 
 
379 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1946  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.98 
 
 
360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152977  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  37.74 
 
 
361 aa  219  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.690404  normal  0.0268262 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2207  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.49 
 
 
381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.499624 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1582  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  40.62 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0310843  decreased coverage  0.00561469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5543  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.28 
 
 
384 aa  213  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.59554 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0841  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.62 
 
 
361 aa  212  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.174319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4569  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.56 
 
 
378 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0102197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0293  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  38.79 
 
 
337 aa  210  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.637875  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0319  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.94 
 
 
382 aa  210  3e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.86 
 
 
410 aa  209  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0060  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.05 
 
 
393 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000156365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0247  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.97 
 
 
388 aa  207  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.29 
 
 
388 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.29 
 
 
388 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0808  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.05 
 
 
386 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0438  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.03 
 
 
381 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.179512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0651  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.05 
 
 
388 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.889445  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.29 
 
 
388 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2117  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.5 
 
 
387 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2037  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.5 
 
 
387 aa  203  3e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325125  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1220  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  34.14 
 
 
377 aa  203  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.23479  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0095  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  38.48 
 
 
359 aa  202  9e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1276  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  33.78 
 
 
383 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.295759  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.75 
 
 
384 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.77 
 
 
391 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.130475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.69 
 
 
392 aa  200  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0101731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  35.25 
 
 
391 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4117  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.88 
 
 
395 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1243  Succinate--CoA ligase (ADP-forming)  33.6 
 
 
393 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766366  hitchhiker  0.00547287 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.94 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2062  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  30.93 
 
 
384 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.51 
 
 
386 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.51 
 
 
386 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.51 
 
 
386 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.51 
 
 
386 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1123  succinate--CoA ligase  36.09 
 
 
368 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.38296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.51 
 
 
386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2714  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
382 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0773834 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.51 
 
 
386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0932  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.63 
 
 
389 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.16 
 
 
392 aa  196  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.51 
 
 
386 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.78 
 
 
386 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1801  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.43 
 
 
389 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.198712  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.3 
 
 
382 aa  195  9e-49  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0815  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.37 
 
 
389 aa  195  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04270  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.46 
 
 
389 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.6 
 
 
386 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
386 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.25 
 
 
392 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.05 
 
 
386 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4221  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.6 
 
 
396 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.687915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.24 
 
 
386 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0604  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.6 
 
 
392 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.575557  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3930  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.53 
 
 
379 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0737  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  32.4 
 
 
385 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1889  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.7 
 
 
387 aa  193  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0380  succinyl-CoA synthetase subunit beta  30.81 
 
 
392 aa  193  3e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3203  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.01 
 
 
379 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2012  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.16 
 
 
388 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2202  succinyl-CoA synthase, beta subunit  32.16 
 
 
388 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00971799  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.06 
 
 
385 aa  192  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.6 
 
 
388 aa  192  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.131482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2086  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.63 
 
 
382 aa  192  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10969  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.89 
 
 
387 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.333695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0599  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.04 
 
 
387 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0580  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.04 
 
 
387 aa  190  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0654  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.89 
 
 
393 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.715889  normal  0.308517 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0979  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.32 
 
 
387 aa  191  2e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2178  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.06 
 
 
387 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.84529  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04920  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.6 
 
 
389 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.819244  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1865  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.63 
 
 
387 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0610709 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1671  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.54 
 
 
388 aa  190  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1617  succinyl-CoA synthetase subunit beta  31.89 
 
 
388 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09090  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.51 
 
 
389 aa  189  4e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0911  succinyl-CoA synthetase subunit beta  36.64 
 
 
385 aa  189  5e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.793217  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0148  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
386 aa  189  5.999999999999999e-47  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0183836  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  33.76 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1088  succinyl-CoA synthetase subunit beta  33.33 
 
 
385 aa  189  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.226622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3509  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.43 
 
 
388 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.019231  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.43 
 
 
388 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146804  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  31.17 
 
 
386 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  34.05 
 
 
391 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.014872  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1668  succinyl-CoA synthetase subunit beta  32.43 
 
 
388 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.11525  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0727  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  30.73 
 
 
400 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.813583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>