More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0911 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0911  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 
385 aa  775    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.793217  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1137  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.22 
 
 
387 aa  564  1e-160  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1397  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.62 
 
 
387 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.35 
 
 
387 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0558  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.35 
 
 
387 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.679932  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.84 
 
 
391 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1050  succinyl-CoA synthetase subunit beta  62.23 
 
 
391 aa  442  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.179729  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1882  succinyl-CoA synthetase beta chain (SCS-alpha)(vegetative protein 63) (VEG63)  55.96 
 
 
390 aa  420  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.47 
 
 
386 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
386 aa  402  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.47 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.47 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.47 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.47 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.47 
 
 
386 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.47 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.73 
 
 
386 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.47 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.01 
 
 
400 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.08 
 
 
390 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.77 
 
 
399 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.95 
 
 
388 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.69 
 
 
386 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.95 
 
 
388 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.66 
 
 
392 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.06 
 
 
389 aa  394  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  52.74 
 
 
388 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.34 
 
 
392 aa  394  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.37 
 
 
388 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.69 
 
 
388 aa  390  1e-107  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 
391 aa  388  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.03 
 
 
398 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  56.37 
 
 
388 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.56 
 
 
392 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  49.75 
 
 
410 aa  385  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.34 
 
 
391 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.6 
 
 
398 aa  385  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  50.9 
 
 
389 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.04 
 
 
390 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.95 
 
 
384 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.58 
 
 
388 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.72 
 
 
388 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.26 
 
 
398 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.6 
 
 
386 aa  384  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.68 
 
 
389 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.51 
 
 
398 aa  382  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.65 
 
 
426 aa  383  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.53 
 
 
389 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.77 
 
 
386 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  50.94 
 
 
389 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.77 
 
 
386 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
399 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  53.39 
 
 
387 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  53.12 
 
 
386 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.77 
 
 
399 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.77 
 
 
399 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.77 
 
 
397 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.74 
 
 
397 aa  379  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.39 
 
 
389 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.34 
 
 
388 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  48.31 
 
 
392 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2162  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.97 
 
 
398 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.34 
 
 
388 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  48.2 
 
 
390 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.7 
 
 
395 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.42 
 
 
388 aa  377  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
398 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.19 
 
 
388 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  48.2 
 
 
390 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  48.57 
 
 
390 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.13 
 
 
382 aa  377  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
397 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.23 
 
 
386 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1547  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.91 
 
 
389 aa  375  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00163339  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1831  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.49 
 
 
389 aa  374  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.410462  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.49 
 
 
397 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
383 aa  373  1e-102  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1124  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.46 
 
 
398 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101156  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.13 
 
 
389 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3364  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.19 
 
 
386 aa  372  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.23 
 
 
397 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.49 
 
 
397 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.56 
 
 
386 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.56 
 
 
386 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.11 
 
 
386 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.71 
 
 
386 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.74 
 
 
397 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1716  malate--CoA ligase subunit beta  50.27 
 
 
399 aa  371  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.67 
 
 
392 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.93 
 
 
389 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.45 
 
 
388 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.11 
 
 
392 aa  369  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.37 
 
 
389 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.37 
 
 
389 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0919  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.39 
 
 
386 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0072  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.57 
 
 
386 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.442706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.37 
 
 
392 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  47.53 
 
 
392 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.26 
 
 
398 aa  368  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>