More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1137 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1137  succinyl-CoA synthetase subunit beta  100 
 
 		 387 aa  776    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0911  succinyl-CoA synthetase subunit beta  74.22 
 
 		 385 aa  565  1e-160  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.793217  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.03 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0558  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.03 
 
 		 387 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.679932  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1397  succinyl-CoA synthetase subunit beta  65.03 
 
 		 387 aa  475  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  59.13 
 
 		 391 aa  461  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1882  succinyl-CoA synthetase beta chain (SCS-alpha)(vegetative protein 63) (VEG63)  58.46 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1050  succinyl-CoA synthetase subunit beta  59.84 
 
 		 391 aa  433  1e-120  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.179729  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.92 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.92 
 
 		 386 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.4 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.15 
 
 		 386 aa  419  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.15 
 
 		 386 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.49 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.89 
 
 		 386 aa  414  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.89 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.15 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  54.15 
 
 		 388 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.89 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.89 
 
 		 388 aa  396  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  53.35 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.73 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.95 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.53 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.6 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.95 
 
 		 392 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.95 
 
 		 392 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3223  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.44 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.835206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.91 
 
 		 388 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1040  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.85 
 
 		 389 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.56 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.26 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.77 
 
 		 389 aa  387  1e-106  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.55 
 
 		 384 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  50.39 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 383 aa  384  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0154  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.37 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.306338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.78 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  52.59 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.24 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.12 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.63 
 
 		 398 aa  382  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.12 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.24 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0554  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.79 
 
 		 388 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2261  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  51.81 
 
 		 386 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.139479  hitchhiker  0.0000000854981 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.74 
 
 		 399 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0674  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.67 
 
 		 389 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4349  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.81 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.741807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3292  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.25 
 
 		 389 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.251012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2789  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  51.16 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.799374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.75 
 
 		 399 aa  376  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.99 
 
 		 398 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1464  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  50.9 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0469  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.05 
 
 		 388 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.64 
 
 		 426 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.37 
 
 		 410 aa  371  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2184  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.27 
 
 		 387 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0530  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.79 
 
 		 389 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00340695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.99 
 
 		 398 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  50.26 
 
 		 389 aa  375  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3945  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.29 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.87 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5192  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.07 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2699  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.59 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2401  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.19 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0817  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.19 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3197  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.03 
 
 		 399 aa  368  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0869  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.3 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0275  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.19 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.19 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0495  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.59 
 
 		 386 aa  371  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000993882 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0975  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.19 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.24 
 
 		 398 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  47.16 
 
 		 396 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3392  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.94 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0646  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.72 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2675  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.19 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4682  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.37 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.25 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0014  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.19 
 
 		 388 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.74 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  47.06 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3953  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.24 
 
 		 386 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4047  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.94 
 
 		 386 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4684  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.24 
 
 		 386 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0443  succinyl-CoA synthetase subunit beta  51.46 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0251  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.98 
 
 		 392 aa  365  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  46.55 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  46.55 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  46.41 
 
 		 392 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  46.61 
 
 		 395 aa  366  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.49 
 
 		 397 aa  365  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4482  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.83 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>