More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1882 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1882  succinyl-CoA synthetase beta chain (SCS-alpha)(vegetative protein 63) (VEG63)  100 
 
 
390 aa  789    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.028158  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1137  succinyl-CoA synthetase subunit beta  58.46 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1087  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  52.06 
 
 
391 aa  398  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000260623  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0911  succinyl-CoA synthetase subunit beta  55.96 
 
 
385 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.793217  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0637  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.54 
 
 
387 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1397  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.54 
 
 
387 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0558  succinyl-CoA synthetase subunit beta  53.28 
 
 
387 aa  382  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.679932  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0620  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50.39 
 
 
389 aa  369  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105579  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1050  succinyl-CoA synthetase subunit beta  52.39 
 
 
391 aa  363  2e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.179729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1099  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.84 
 
 
386 aa  362  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.367484  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0776  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.19 
 
 
392 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0667  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.92 
 
 
391 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1058  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.58 
 
 
385 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161245  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1304  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00442695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1329  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
388 aa  356  2.9999999999999997e-97  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1625  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.47 
 
 
398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.357974  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1747  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  47 
 
 
388 aa  355  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.655584  normal  0.0712805 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2488  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.79 
 
 
386 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000281864  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0925  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.32 
 
 
382 aa  354  1e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100196  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0497  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.18 
 
 
391 aa  355  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.892207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0338  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.11 
 
 
390 aa  354  1e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.210616  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1452  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.55 
 
 
389 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.567076  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0813  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.06 
 
 
388 aa  354  2e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0845354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.77 
 
 
392 aa  353  4e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0957  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.77 
 
 
389 aa  352  5e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1992  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.8 
 
 
386 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0729  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.19 
 
 
385 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000827995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6556  malate--CoA ligase subunit beta  47.57 
 
 
392 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.0575552 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.53 
 
 
386 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000279608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3687  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.53 
 
 
386 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000356944  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3577  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.53 
 
 
386 aa  352  8e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000022371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3595  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.53 
 
 
386 aa  352  8e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000384481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3974  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.53 
 
 
386 aa  352  8e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000205327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3883  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.53 
 
 
386 aa  352  8e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000224565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0245  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.8 
 
 
386 aa  351  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000419135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1309  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.27 
 
 
386 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000115042  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1751  malate--CoA ligase subunit beta  46.67 
 
 
390 aa  351  1e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3659  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.79 
 
 
386 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1210  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.68 
 
 
383 aa  351  2e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3934  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.27 
 
 
386 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000073061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7116  malate--CoA ligase subunit beta  47.31 
 
 
392 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00456682  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1716  malate--CoA ligase subunit beta  47.71 
 
 
399 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.311565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0607  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.14 
 
 
390 aa  350  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0260  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.8 
 
 
386 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0559  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.73 
 
 
397 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.335681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2135  malate--CoA ligase subunit beta  46.67 
 
 
390 aa  350  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.313278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1799  malate--CoA ligase subunit beta  46.67 
 
 
390 aa  350  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.313721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0623  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.72 
 
 
392 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.420642  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0251  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  47.45 
 
 
392 aa  346  3e-94  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0079  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.48 
 
 
397 aa  347  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3514  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.73 
 
 
397 aa  346  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.764048  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3666  malate--CoA ligase subunit beta  46.74 
 
 
392 aa  345  7e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127325  normal  0.209823 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.23 
 
 
397 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.426035  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0967  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.23 
 
 
397 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3998  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.65 
 
 
387 aa  343  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0030268  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1211  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  45.84 
 
 
399 aa  344  2e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0920  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.48 
 
 
398 aa  343  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492661  normal  0.231916 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1079  malate--CoA ligase subunit beta  45.1 
 
 
396 aa  343  4e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00492419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0193  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.84 
 
 
399 aa  343  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1375  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.05 
 
 
384 aa  342  7e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3170  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.15 
 
 
399 aa  342  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0821  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.73 
 
 
397 aa  341  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2717  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.91 
 
 
387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4359  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.79 
 
 
403 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.129325 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3257  malate--CoA ligase subunit beta  45.99 
 
 
389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2878  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.72 
 
 
397 aa  339  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1996  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.36 
 
 
398 aa  339  5e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1644  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.09 
 
 
398 aa  338  7e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.47315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0186  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.72 
 
 
398 aa  338  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.984943  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0713  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.67 
 
 
389 aa  338  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00106571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1586  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  44.84 
 
 
398 aa  338  9e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.991981  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1926  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.09 
 
 
398 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15774  normal  0.826279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3398  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  46.39 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.694638 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0544  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.48 
 
 
397 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1627  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.58 
 
 
388 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3724  succinyl-CoA synthetase subunit beta  46.93 
 
 
392 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.637154  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0490  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  45.86 
 
 
410 aa  335  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0393  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.72 
 
 
398 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268228  normal  0.21905 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0148  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.56 
 
 
386 aa  334  1e-90  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0183836  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2233  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.32 
 
 
388 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2321  succinyl-CoA synthetase subunit beta  48.32 
 
 
388 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0456316  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0979  succinyl-CoA synthetase subunit beta  49.08 
 
 
387 aa  334  1e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2069  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) beta subunit  48.68 
 
 
387 aa  334  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000114412  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2240  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.83 
 
 
403 aa  333  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1694  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.79 
 
 
395 aa  332  5e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0023  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.23 
 
 
398 aa  332  6e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0458  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
388 aa  332  7.000000000000001e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.539778  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0155  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.36 
 
 
388 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3486  succinyl-CoA synthetase, beta subunit  48.36 
 
 
388 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.333849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0280  succinyl-CoA synthetase subunit beta  43.97 
 
 
398 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0625888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0176  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.8 
 
 
426 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5927  malate--CoA ligase subunit beta  43.59 
 
 
395 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.298211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0474  succinyl-CoA synthetase subunit beta  50 
 
 
388 aa  332  9e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2943  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.47 
 
 
398 aa  331  1e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1740  succinyl-CoA synthase, beta subunit  46.47 
 
 
389 aa  331  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0062076  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0420  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.33 
 
 
399 aa  331  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3973  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.74 
 
 
397 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0536  succinyl-CoA synthetase subunit beta  44.62 
 
 
399 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3197  succinyl-CoA synthetase subunit beta  47.69 
 
 
399 aa  329  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0229  succinyl-CoA synthetase subunit beta  45.98 
 
 
399 aa  328  9e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>