More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1058 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1058  Patatin  100 
 
 		 312 aa  621  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1081  patatin  53.72 
 
 		 322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.983144  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1244  Patatin  52.57 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0438678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1382  Patatin  43.87 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.169979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1839  patatin  39.16 
 
 		 264 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0742983  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0432  patatin  38.49 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  34.88 
 
 		 291 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0479  Patatin  35.33 
 
 		 293 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.382119  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3310  patatin-like phospholipase  37 
 
 		 267 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0418  patatin  37.02 
 
 		 294 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.655345 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0189  hypothetical protein  32.85 
 
 		 303 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0906  hypothetical protein  37.5 
 
 		 292 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0209  hypothetical protein  32.49 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0524  Patatin  35 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.607937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  31.95 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  33.97 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3052  patatin  31.89 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.443611  normal  0.0107165 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  34.73 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  33.85 
 
 		 275 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  32.7 
 
 		 346 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  32.7 
 
 		 346 aa  135  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  33.79 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0057  hypothetical protein  34.08 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.771152 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  32.29 
 
 		 323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  31.6 
 
 		 323 aa  132  7.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2884  Patatin  31.99 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  32 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  32.7 
 
 		 345 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0457  patatin  31.82 
 
 		 322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.98723  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  31.52 
 
 		 275 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2623  patatin  32.39 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0385483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  32.36 
 
 		 263 aa  129  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0190  Patatin  31.13 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  34.41 
 
 		 298 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  31.58 
 
 		 741 aa  129  8.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  32.44 
 
 		 348 aa  129  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  32.95 
 
 		 256 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  29.74 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2451  patatin  28.05 
 
 		 343 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000295185 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  33.33 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1418  patatin  30.79 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.84629  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  36.3 
 
 		 767 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2444  patatin  28.48 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  31.56 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  32.18 
 
 		 275 aa  125  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  33.47 
 
 		 347 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4637  patatin  33.45 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0400128 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1014  hypothetical protein  28.62 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  33.47 
 
 		 474 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  32.62 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  33.47 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  33.47 
 
 		 347 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2063  patatin  38.02 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.340331  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  31.64 
 
 		 263 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.95 
 
 		 358 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  33.47 
 
 		 306 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  33.07 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  33.33 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  33.2 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0981  hypothetical protein  28.28 
 
 		 292 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4504  patatin  33 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  31.99 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  33.59 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  35.19 
 
 		 813 aa  123  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  30.43 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  30.91 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  40.78 
 
 		 335 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  32.93 
 
 		 315 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  31.27 
 
 		 263 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  30.94 
 
 		 346 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  30.91 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  32.53 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  30.91 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5212  hypothetical protein  30.87 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  30.91 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  33.68 
 
 		 735 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  30.91 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  34.07 
 
 		 750 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  31.51 
 
 		 740 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  30.91 
 
 		 263 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  34.51 
 
 		 273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  30.55 
 
 		 263 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  31.89 
 
 		 335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  33.12 
 
 		 738 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2202  hypothetical protein  28.85 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1593  Patatin  31.51 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.33 
 
 		 323 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11081  hypothetical protein  38.12 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000132492  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  33.33 
 
 		 667 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1595  patatin  32.55 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.613745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  32.94 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  32.22 
 
 		 302 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  31.33 
 
 		 308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1661  patatin  30.35 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2697  Patatin  30.35 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00646422  hitchhiker  0.0000697088 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0176  Patatin  34.87 
 
 		 327 aa  119  7e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000373316  decreased coverage  0.00000313207 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1683  patatin  30.35 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.234772  normal  0.666571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1646  patatin  30.35 
 
 		 315 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0830  Patatin  28.81 
 
 		 299 aa  119  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00263851  normal  0.492745 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  31.8 
 
 		 305 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>