36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0795 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0795  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1293    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.492982  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3897  hypothetical protein  36.06 
 
 		 648 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0873  hypothetical protein  33.27 
 
 		 580 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.386857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0796  hypothetical protein  35.1 
 
 		 648 aa  150  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  30.24 
 
 		 634 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 		 762 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 792 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 708 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 827 aa  132  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  25.92 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 812 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0865  hypothetical protein  29.02 
 
 		 483 aa  96.3  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.417049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.4 
 
 		 699 aa  82.8  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 639 aa  76.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  30.08 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  22.46 
 
 		 657 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  29.91 
 
 		 566 aa  68.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  24.67 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 697 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 		 653 aa  65.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 		 657 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.05 
 
 		 654 aa  63.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 		 570 aa  62  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 766 aa  61.6  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  29.88 
 
 		 566 aa  62  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  27.12 
 
 		 546 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  24.4 
 
 		 582 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0677  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 616 aa  51.2  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3075  TPR repeat-containing protein  25.3 
 
 		 602 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320155  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0965  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1084 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  25.49 
 
 		 648 aa  45.4  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  24.87 
 
 		 579 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.45 
 
 		 576 aa  43.9  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  26.29 
 
 		 640 aa  43.9  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>