More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0514 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  100 
 
 
503 aa  1011    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  76.04 
 
 
516 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  71.46 
 
 
565 aa  609  1e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  70.1 
 
 
697 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.03 
 
 
618 aa  585  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0707  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.92 
 
 
544 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.03 
 
 
565 aa  556  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.66 
 
 
580 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.28 
 
 
593 aa  542  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3809  DEAD/DEAH box helicase-like  61.43 
 
 
649 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.130283  normal  0.862178 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.91 
 
 
598 aa  538  9.999999999999999e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2505  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.92 
 
 
561 aa  537  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000169181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0916  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.57 
 
 
671 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0853384  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4254  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.44 
 
 
611 aa  535  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.214353  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2785  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.18 
 
 
585 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.57 
 
 
582 aa  529  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0824  DEAD/DEAH box helicase domain protein  63.5 
 
 
609 aa  526  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920736  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19230  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.19 
 
 
499 aa  522  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.12209  normal  0.0355772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06650  DNA/RNA helicase, superfamily II  63.53 
 
 
559 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2167  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.47 
 
 
586 aa  521  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0230616  decreased coverage  0.0000613257 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0774  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.93 
 
 
605 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.09 
 
 
611 aa  514  1e-144  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0379  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.89 
 
 
621 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.65 
 
 
548 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000480349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7820  DEAD/DEAH box helicase domain protein  69.91 
 
 
795 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1393  DEAD/DEAH box helicase-like protein  58.72 
 
 
507 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1411  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.72 
 
 
507 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1447  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.2 
 
 
507 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.566977  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13237  ATP-dependent RNA helicase rhlE  58.8 
 
 
527 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462148 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.09 
 
 
557 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1791  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.5 
 
 
494 aa  481  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274461  normal  0.240884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4676  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.71 
 
 
505 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278319  normal  0.217284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3515  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.47 
 
 
543 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.394207  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.77 
 
 
536 aa  476  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1469  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.48 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45325  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0777  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  47.06 
 
 
528 aa  343  2.9999999999999997e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.08 
 
 
533 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.73 
 
 
541 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  47.29 
 
 
527 aa  339  9e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.9 
 
 
546 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.63 
 
 
546 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.11 
 
 
541 aa  335  9e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.26 
 
 
565 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.29 
 
 
538 aa  331  2e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.18 
 
 
550 aa  326  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.13 
 
 
640 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.83 
 
 
571 aa  325  1e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.8 
 
 
590 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.41 
 
 
640 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  45.03 
 
 
551 aa  324  2e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.41 
 
 
640 aa  324  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.41 
 
 
640 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.41 
 
 
640 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.28 
 
 
539 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000955018  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.25 
 
 
532 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.89 
 
 
623 aa  322  7e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  41.6 
 
 
530 aa  322  9.000000000000001e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.9 
 
 
448 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.487867  normal  0.156887 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.08 
 
 
532 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  46.15 
 
 
507 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.71 
 
 
511 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.26 
 
 
525 aa  320  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  46.26 
 
 
528 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.26 
 
 
528 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  46.26 
 
 
528 aa  320  3e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  46.26 
 
 
528 aa  320  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  43.98 
 
 
572 aa  320  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.26 
 
 
528 aa  320  3e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  46.26 
 
 
533 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  46.26 
 
 
525 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.08 
 
 
527 aa  320  5e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.89 
 
 
492 aa  319  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441599  hitchhiker  0.00900105 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  43.61 
 
 
579 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.51 
 
 
415 aa  319  7.999999999999999e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  47.31 
 
 
460 aa  319  9e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.96 
 
 
528 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.96 
 
 
528 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.62 
 
 
622 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.5 
 
 
584 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.65 
 
 
529 aa  317  3e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  45.71 
 
 
529 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.6 
 
 
747 aa  317  3e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.08 
 
 
530 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.43 
 
 
538 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.63 
 
 
581 aa  317  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2292  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.21 
 
 
482 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.229861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.35 
 
 
622 aa  316  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.09 
 
 
646 aa  316  8e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.35 
 
 
619 aa  315  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  45.74 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.26 
 
 
383 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  44.19 
 
 
509 aa  315  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.91 
 
 
590 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.04 
 
 
467 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.35 
 
 
599 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.35 
 
 
637 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  44.47 
 
 
656 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.78 
 
 
694 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.24 
 
 
437 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.68 
 
 
583 aa  313  4.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>