More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1631 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1631  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
474 aa  904    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.599529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3029  Sodium/hydrogen exchanger  63.19 
 
 
453 aa  534  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.75325  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1868  sodium/hydrogen exchanger  66.98 
 
 
469 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4724  sodium/hydrogen exchanger  64.33 
 
 
473 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.934987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0608  sodium/hydrogen exchanger  62.25 
 
 
467 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0593  sodium/hydrogen exchanger  62.25 
 
 
467 aa  507  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0863  sodium/hydrogen exchanger  66.13 
 
 
513 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0750424  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2594  sodium/hydrogen exchanger  64.1 
 
 
491 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.131358  normal  0.15214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1464  Sodium/hydrogen exchanger  65.51 
 
 
485 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000329156  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1799  sodium/hydrogen exchanger  60.35 
 
 
462 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2359  Na+/H+ antiporter  57.52 
 
 
460 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17221  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.07 
 
 
457 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.597221 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25931  putative Na+/H+ antiporter, CPA2 family  44.8 
 
 
457 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1175  Na+/H+ antiporter  41.78 
 
 
457 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20501  CPA2 family Na+/H+ antiporter  41.78 
 
 
457 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0786073  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18091  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.99 
 
 
455 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1692  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.37 
 
 
455 aa  292  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0153  CPA2 family Na+/H+ antiporter  45.43 
 
 
458 aa  292  8e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.430918  normal  0.17839 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17921  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.37 
 
 
455 aa  292  9e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0183  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.39 
 
 
458 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17871  CPA2 family Na+/H+ antiporter  44.74 
 
 
455 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3809  sodium/hydrogen exchanger  39.81 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.397158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3726  sodium/hydrogen exchanger  40.53 
 
 
413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3668  Sodium/hydrogen exchanger  39.06 
 
 
415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1557  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 
404 aa  210  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00176225  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0839  hypothetical protein  34.38 
 
 
479 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0868  hypothetical protein  34.38 
 
 
479 aa  198  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3217  sodium/hydrogen exchanger  34.77 
 
 
397 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0255  sodium/hydrogen exchanger  33.94 
 
 
398 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79751  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0722  sodium/hydrogen exchanger family protein  33.18 
 
 
427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.313467  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0655  sodium/hydrogen exchanger  33.11 
 
 
424 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0120  sodium/hydrogen exchanger  35.14 
 
 
385 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3964  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 
402 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0770173  normal  0.0859803 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_628  Kef-type K+ transport systems membrane component  32.34 
 
 
424 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1675  germination protein gerN  31.73 
 
 
387 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000302392  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1332  potassium efflux system protein  31.12 
 
 
385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2444  sodium/hydrogen exchanger  31.28 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00360852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1521  germination protein gerN  31.49 
 
 
387 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000601236  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1526  potassium efflux system protein  32.37 
 
 
387 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.848534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1639  germination protein gern  31.49 
 
 
387 aa  164  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.481694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1729  germination protein gerN  31.49 
 
 
387 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1780  germination protein gerN  31.25 
 
 
387 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00295662  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1483  Na+/H+ exchanger family protein  31.25 
 
 
387 aa  163  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000497564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3669  germination protein gerN  31.12 
 
 
387 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000427463  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1493  Na+/H+ exchanger family protein  31.25 
 
 
387 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000735632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1706  germination protein gerN  31.25 
 
 
387 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1320  sodium/hydrogen exchanger  31.69 
 
 
382 aa  160  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0227  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  32.26 
 
 
399 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0780  germination protein gerN  31.73 
 
 
375 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0729  Na+/H+ antiporter (NapA)  31.73 
 
 
375 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0915  germination protein gerN  31.73 
 
 
375 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42795e-41 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0819  germination protein gern  31.73 
 
 
375 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0227  Na/H antiporter (napA)  35.67 
 
 
399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.751994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0873  germination protein gerN  31.49 
 
 
375 aa  155  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4462  germination protein gerN  31.49 
 
 
375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.765663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0667  potassium efflux system protein  31.33 
 
 
375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2265  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 
400 aa  154  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0729  potassium efflux system protein  31.57 
 
 
375 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1965  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.28 
 
 
418 aa  153  5.9999999999999996e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00243073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0715  Na+/H+ antiporter (NapA)  33.53 
 
 
375 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0910  germination protein gerN  33.24 
 
 
375 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0984  germination protein gerN  33.24 
 
 
375 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0841  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.278715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4248  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.646884  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3462  sodium/hydrogen exchanger  30.75 
 
 
750 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0330875 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1695  sodium/hydrogen exchanger  28.36 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000892043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1827  Kef-type K+ transport system, membrane component  29.38 
 
 
386 aa  140  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0581  sodium/hydrogen exchanger  30.88 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0764  sodium/hydrogen exchanger  34.47 
 
 
395 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00200926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3439  sodium/hydrogen exchanger  30.05 
 
 
445 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0706  sodium/hydrogen exchanger  33.43 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.584868  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0200  sodium/hydrogen exchanger  31.25 
 
 
389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0769976  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1782  sodium/hydrogen exchanger  31.1 
 
 
389 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3112  sodium/hydrogen exchanger  29.24 
 
 
748 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2186  Na+/H+ antiporter  30.66 
 
 
379 aa  133  6.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0326583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0964  Na+/H+ exchanger family protein  31.74 
 
 
375 aa  131  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000622449  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1576  sodium/hydrogen exchanger  28.8 
 
 
392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  decreased coverage  0.000000405712  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1633  hypothetical protein  30.87 
 
 
423 aa  127  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0669  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 
388 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1099  sodium/hydrogen exchanger  28.88 
 
 
392 aa  125  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1355  Kef-type K+ transport system, membrane component  27.84 
 
 
352 aa  125  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.495043  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1937  sodium/hydrogen exchanger  31.87 
 
 
412 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0847  sodium/hydrogen exchanger  28.87 
 
 
392 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.461656  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0109  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 
388 aa  123  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.254018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2825  sodium/hydrogen exchanger  28.27 
 
 
749 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1792  sodium/hydrogen exchanger  27.38 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.906777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2193  sodium/hydrogen exchanger  29.75 
 
 
460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0736  sodium/hydrogen exchanger  27.35 
 
 
495 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.67035  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0056  sodium/hydrogen exchanger  28.17 
 
 
388 aa  117  3e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0601402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  27.95 
 
 
587 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  29.5 
 
 
586 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6352  sodium/hydrogen exchanger  29.72 
 
 
436 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  27.22 
 
 
587 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  28.19 
 
 
585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0578  sodium/hydrogen exchanger  27.02 
 
 
756 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4159  sodium/hydrogen exchanger  30.47 
 
 
446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.286241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  27.89 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3878  sodium/hydrogen exchanger  25.78 
 
 
715 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.267583  normal  0.485697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  28.19 
 
 
586 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  28.37 
 
 
586 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.496723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>