78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0998 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0998  phycobilisome protein  100 
 
 		 177 aa  354  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5733  Phycobilisome protein  79.35 
 
 		 184 aa  286  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0997  phycobilisome protein  88.46 
 
 		 179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.401472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1903  C-phycoerythrin class I beta chain  71.74 
 
 		 184 aa  272  2.0000000000000002e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0426  C-phycoerythrin class I beta chain  72.28 
 
 		 184 aa  271  4.0000000000000004e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0541832 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0435  C-phycoerythrin class II beta chain  73.03 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.630208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0984  phycobilisome protein  72.07 
 
 		 179 aa  249  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4516  Phycobilisome protein  68.82 
 
 		 184 aa  248  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.667174  normal  0.759424 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1893  C-phycoerythrin class II beta chain  70.22 
 
 		 178 aa  245  3e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03321  phycobilisome protein  64.29 
 
 		 182 aa  237  5e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.992978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1671  phycoerythrin class III beta chain CpeB  64.09 
 
 		 182 aa  233  8e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.981553  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03851  phycobilisome protein  63.54 
 
 		 182 aa  231  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.387439  normal  0.0394667 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22381  phycobilisome protein (phycoerythrin beta-subunit)  62.98 
 
 		 181 aa  226  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3489  phycocyanin subunit beta  58.52 
 
 		 173 aa  197  7e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.132274  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0161  phycocyanin, beta subunit  53.11 
 
 		 172 aa  191  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0157143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3046  phycocyanin, beta subunit  54.24 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.241036 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3074  phycocyanin, beta subunit  54.24 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2930  phycocyanin, beta subunit  56.57 
 
 		 173 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1047  phycocyanin, beta subunit  52.84 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264942 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1052  phycocyanin, beta subunit  52.84 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0614393 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5049  phycocyanin, beta subunit  53.67 
 
 		 172 aa  181  6e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0421  phycocyanin, beta subunit  50.85 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.444551  normal  0.0102401 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1908  phycocyanin, beta subunit  50.28 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1697  phycocyanin, beta subunit  52.54 
 
 		 172 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0569102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2871  phycocyanin, beta subunit  50.28 
 
 		 173 aa  174  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.001828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2925  phycobilisome protein  49.43 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.743765 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0297  phycocyanin  45.2 
 
 		 172 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0307  phycobilisome protein  43.05 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03291  phycobilisome protein  40.72 
 
 		 170 aa  129  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.107575  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03391  phycobilisome protein  39.39 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  decreased coverage  0.0000255558  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03301  phycobilisome protein  41.72 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0424688  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2433  allophycocyanin subunit beta  37.29 
 
 		 161 aa  117  7.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2198  allophycocyanin, beta subunit  38.04 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.209436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2635  allophycocyanin, beta subunit  37.65 
 
 		 161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.872532 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1838  allophycocyanin, beta subunit  43.38 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0478  allophycocyanin subunit beta  37.42 
 
 		 162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3649  allophycocyanin, beta subunit  36.16 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4995  allophycocyanin, beta subunit  37.04 
 
 		 161 aa  111  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2787  allophycocyanin, beta subunit  37.04 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3314  allophycocyanin, beta subunit  37.04 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.252863  normal  0.514162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2622  allophycocyanin subunit beta  39.04 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000519152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0326  allophycocyanin, beta subunit  38.56 
 
 		 161 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3714  allophycocyanin subunit beta  41.48 
 
 		 169 aa  105  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0836  allophycocyanin, beta subunit  39.26 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0807  allophycocyanin, beta subunit  39.26 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2158  allophycocyanin, beta subunit  40.74 
 
 		 169 aa  102  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.117543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3835  allophycocyanin, beta subunit  38.52 
 
 		 169 aa  101  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0146  allophycocyanin subunit beta  41.48 
 
 		 169 aa  97.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1264  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  40.37 
 
 		 174 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1206  phycobilisome core component-allophycocyanin beta-18 subunit  35.82 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.74383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2202  allophycocyanin, beta subunit  40 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000292042 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1034  Phycobilisome protein  31.98 
 
 		 161 aa  90.9  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.347027  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2432  phycocyanin  30.41 
 
 		 161 aa  88.6  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1256  Phycobilisome protein  30.23 
 
 		 161 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000277966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1226  Phycobilisome protein  30.23 
 
 		 161 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3650  phycobilisome protein  29.07 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4994  Phycobilisome protein  29.55 
 
 		 161 aa  88.2  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0327  allophycocyanin alpha chain  30.81 
 
 		 161 aa  87.8  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.858451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2621  phycobilisome protein  29.65 
 
 		 161 aa  87.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000016384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1133  allophycocyanin alpha-B chain  32.9 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.562521  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3635  phycobilisome protein  29.65 
 
 		 161 aa  84  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0479  allophycocyanin alpha chain  30.23 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0240  hypothetical protein  29.65 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.124285 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1969  Phycobilisome protein  28.49 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2634  Phycobilisome protein  28.49 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.515637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2197  allophycocyanin alpha chain  28.49 
 
 		 161 aa  80.5  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.210931  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3655  phycocyanin  30.23 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.792917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2786  Phycobilisome protein  28.49 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3315  Phycobilisome protein  28.49 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.613477  normal  0.164166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1341  allophycocyanin alpha-B chain  31.97 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.445808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4799  phycobilisome protein  29.93 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0384087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4519  Phycobilisome protein  22.58 
 
 		 194 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1880  phycobilisome polypeptide  27.71 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0447  phycobilisome polypeptide  30.34 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.231003 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5726  Phycobilisome protein  25.89 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3240  phycobilisome protein  22.79 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2931  phycocyanin, alpha subunit  27.68 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0328  phycobilisome core-membrane linker polypeptide  35 
 
 		 705 aa  41.6  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.546381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>