95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0214 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0214  GHMP kinase  100 
 
 
355 aa  736    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0700927  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34345  predicted protein  38.08 
 
 
358 aa  235  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.190727  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  28.7 
 
 
359 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0579  GHMP kinase  26.61 
 
 
361 aa  66.2  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000495739  decreased coverage  0.000433765 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  26.14 
 
 
403 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  28.27 
 
 
389 aa  62.8  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  27.81 
 
 
384 aa  58.2  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0532  galactokinase  26.89 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.560664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  26.13 
 
 
395 aa  56.6  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  23.05 
 
 
386 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  28 
 
 
372 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  24.15 
 
 
414 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  25.54 
 
 
349 aa  53.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  29.12 
 
 
405 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  23.85 
 
 
389 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  28.14 
 
 
387 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  25.66 
 
 
351 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  24.59 
 
 
386 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  26.79 
 
 
388 aa  52.4  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  24.64 
 
 
385 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  27.57 
 
 
373 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  21.53 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  21.53 
 
 
350 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1114  GHMP kinase  26.48 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  23.28 
 
 
379 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  28.64 
 
 
383 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  23.14 
 
 
376 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  26.09 
 
 
391 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1934  galactokinase  25.71 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.210895 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  28.35 
 
 
388 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1677  galactokinase  28.09 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000114591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  24.89 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  24.83 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0467  mevalonate kinase  23.86 
 
 
314 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.250256  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  24.83 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2481  galactokinase  23.75 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.883324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  24.83 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4110  galactokinase  24.05 
 
 
356 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  24.83 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  24.83 
 
 
382 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  24.49 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4019  galactokinase  24.46 
 
 
357 aa  47.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  22.96 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2152  galactokinase  26.19 
 
 
358 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  24.01 
 
 
394 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  28.04 
 
 
397 aa  47  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  27.46 
 
 
385 aa  47  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  24.89 
 
 
383 aa  46.6  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  23.55 
 
 
382 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  25.84 
 
 
385 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0316  GHMP kinase  30.84 
 
 
359 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  23.55 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  23.55 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  23.55 
 
 
382 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  23.55 
 
 
382 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  25 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  25.81 
 
 
391 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  24.49 
 
 
382 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  30.4 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1599  mevalonate kinase  21.59 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.309754  normal  0.998273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  30.4 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  27.31 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  25 
 
 
409 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2490  galactokinase  29.17 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1000  GHMP kinase domain protein  23.87 
 
 
370 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00600942  normal  0.518194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4206  galactokinase  27.68 
 
 
376 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  30.4 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  27.31 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  27.31 
 
 
383 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  30.4 
 
 
381 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1736  mevalonate kinase  27.67 
 
 
316 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  25.67 
 
 
355 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  25.54 
 
 
405 aa  44.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3662  galactokinase  26.21 
 
 
412 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0296405  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  25.58 
 
 
380 aa  44.3  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  26.8 
 
 
391 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  21.47 
 
 
386 aa  43.9  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  26.57 
 
 
388 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  26.13 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  23.85 
 
 
392 aa  43.5  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1421  mevalonate kinase  22.68 
 
 
301 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.238571  hitchhiker  0.00767711 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  23.38 
 
 
394 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2174  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  28.81 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2296  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  28.81 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3292  WcbL  28.81 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  27.49 
 
 
369 aa  43.5  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0532  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  28.81 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.22033  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1068  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  28.81 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3243  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  28.81 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3278  D-glycero-D-manno-heptose 7-phosphate kinase  28.81 
 
 
346 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  23.47 
 
 
418 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  26.29 
 
 
387 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  23.47 
 
 
382 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0465  GHMP kinase  26.85 
 
 
360 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0240407  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  26.29 
 
 
387 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>