47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4905 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4905  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 754 aa  1428    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  32.13 
 
 		 994 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  24.03 
 
 		 732 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.93 
 
 		 2145 aa  80.5  0.00000000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1119 aa  75.5  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1550 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 702 aa  67.4  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  26.18 
 
 		 1507 aa  66.2  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2442  hypothetical protein  27.94 
 
 		 762 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.01518  normal  0.0170954 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.44 
 
 		 771 aa  61.2  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  24.73 
 
 		 1611 aa  58.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  24.6 
 
 		 493 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1385  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1437 aa  56.6  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.793645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.71 
 
 		 927 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  25.1 
 
 		 1476 aa  53.9  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.53 
 
 		 924 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.49 
 
 		 909 aa  52  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 		 1186 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  21.88 
 
 		 1180 aa  51.2  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  21.31 
 
 		 1266 aa  51.2  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3361  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.19 
 
 		 454 aa  51.2  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0780323  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1039 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  27.23 
 
 		 919 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 750 aa  49.7  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 1105 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.84 
 
 		 865 aa  47.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1114  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1147 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0258591  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  24.26 
 
 		 653 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 454 aa  47.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 653 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  24.68 
 
 		 603 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 		 824 aa  46.6  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 		 3301 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 681 aa  46.2  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1893  hypothetical protein  29.45 
 
 		 1581 aa  46.2  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 583 aa  45.8  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.38 
 
 		 885 aa  45.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 817 aa  45.1  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1404 aa  44.7  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3640  hypothetical protein  28.11 
 
 		 310 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.04717  decreased coverage  0.00729391 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 235 aa  44.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  34.52 
 
 		 1083 aa  44.7  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  35.05 
 
 		 1406 aa  44.3  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  22.56 
 
 		 816 aa  44.3  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1127  hypothetical protein  28.95 
 
 		 404 aa  44.3  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000689424  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.86 
 
 		 620 aa  43.9  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>