48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4061 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4061  Mannose-6-phosphate isomerase  100 
 
 
379 aa  753    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.716898  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1389  Mannose-6-phosphate isomerase  61.73 
 
 
368 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.299694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0758  hypothetical protein  52.96 
 
 
377 aa  348  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.251792  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0963  hypothetical protein  51.91 
 
 
398 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0900  hypothetical protein  51.97 
 
 
398 aa  315  7e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0343044 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0467  sugar isomerase (SIS)  47.63 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6008  hypothetical protein  47.09 
 
 
399 aa  289  6e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00432482  normal  0.0500394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0753  hypothetical protein  52.11 
 
 
382 aa  285  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5856  RpiR family transcriptional regulator  48.7 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.161411 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2508  hypothetical protein  45.41 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3839  putative transcriptional regulator, RpiR family  41.82 
 
 
385 aa  237  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.05521 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08570  predicted phosphosugar isomerase  37.31 
 
 
386 aa  206  4e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4296  RpiR family transcriptional regulator  38.8 
 
 
381 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.846665  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0299  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  34.93 
 
 
355 aa  192  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0619  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.26 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00109583  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0260  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  35.03 
 
 
340 aa  180  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1271  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.98 
 
 
356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.579985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1238  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.77 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.663245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22730  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.28 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_450  glucose-6-phosphate isomerase  30.34 
 
 
355 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00708074  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0162  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.94 
 
 
319 aa  149  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3943  Mannose-6-phosphate isomerase  29.81 
 
 
339 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00105823  normal  0.562191 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0610  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.35 
 
 
360 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1766  Mannose-6-phosphate isomerase  34.65 
 
 
341 aa  143  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0509  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.95 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0485  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.37 
 
 
355 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.104869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4612  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  33.55 
 
 
349 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.577892  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1427  hypothetical protein  33.78 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1065  hypothetical protein  25.68 
 
 
328 aa  113  6e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.940118 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0660  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  31.71 
 
 
346 aa  113  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31000  hypothetical protein  37.83 
 
 
362 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6325  hypothetical protein  38.11 
 
 
358 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.597613  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1967  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  29.85 
 
 
327 aa  96.7  6e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.68214 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0167  RpiR family transcriptional regulator  23.1 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000739814 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1856  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  32.26 
 
 
276 aa  79.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.575863 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4725  hypothetical protein  30.86 
 
 
369 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.750353  normal  0.310038 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0098  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  28.4 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1738  hypothetical protein  35.77 
 
 
371 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.92254 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2078  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  30.49 
 
 
313 aa  64.7  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.810924  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4166  hypothetical protein  35.9 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00815938  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13285  hypothetical protein  39.18 
 
 
346 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.462766 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2130  bifunctional phosphoglucose/phosphomannose isomerase  27.21 
 
 
300 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.645548  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3298  hypothetical protein  31.9 
 
 
378 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1188  hypothetical protein  34.84 
 
 
366 aa  48.9  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  39.58 
 
 
329 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4258  KpsF/GutQ family protein  36.36 
 
 
324 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1346  hypothetical protein  43.3 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1329  hypothetical protein  43.3 
 
 
363 aa  43.1  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>