More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2158 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2024  argininosuccinate lyase  83.12 
 
 
482 aa  800    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0998023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2158  argininosuccinate lyase  100 
 
 
472 aa  944    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000750754  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3168  argininosuccinate lyase  72.79 
 
 
464 aa  686    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0440728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6070  argininosuccinate lyase  83.91 
 
 
472 aa  801    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.566647  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1256  argininosuccinate lyase  72.31 
 
 
489 aa  639    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.114721 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1744  argininosuccinate lyase  73.61 
 
 
511 aa  694    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814038 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1888  argininosuccinate lyase  67.82 
 
 
487 aa  621  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0427555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1895  argininosuccinate lyase  70.52 
 
 
487 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.329316  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2051  argininosuccinate lyase  66.23 
 
 
476 aa  598  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3069  argininosuccinate lyase  64.36 
 
 
470 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3022  argininosuccinate lyase  67.6 
 
 
486 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5465  argininosuccinate lyase  63.93 
 
 
472 aa  592  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559884  hitchhiker  0.0094933 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3055  argininosuccinate lyase  65.07 
 
 
472 aa  579  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.097869  normal  0.940422 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22260  argininosuccinate lyase  62.74 
 
 
500 aa  579  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5449  argininosuccinate lyase  62.42 
 
 
463 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25560  argininosuccinate lyase  63.93 
 
 
465 aa  561  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1504  argininosuccinate lyase  62.61 
 
 
480 aa  558  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000851302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1503  argininosuccinate lyase  63.27 
 
 
479 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14330  argininosuccinate lyase  61.82 
 
 
486 aa  553  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00125191  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1118  argininosuccinate lyase  61.12 
 
 
474 aa  553  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.542068 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4124  argininosuccinate lyase  63.7 
 
 
485 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.826501  hitchhiker  0.0000576183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2475  argininosuccinate lyase  59.35 
 
 
470 aa  541  1e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3518  argininosuccinate lyase  56.84 
 
 
476 aa  538  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2366  argininosuccinate lyase  60.94 
 
 
476 aa  535  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23929  decreased coverage  0.0035121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1333  argininosuccinate lyase  61.61 
 
 
484 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.279434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2852  argininosuccinate lyase  56.44 
 
 
475 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3155  argininosuccinate lyase  60.6 
 
 
481 aa  531  1e-149  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1648  argininosuccinate lyase  62.36 
 
 
471 aa  528  1e-149  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2396  argininosuccinate lyase  58.79 
 
 
482 aa  525  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21670  argininosuccinate lyase  62.75 
 
 
502 aa  512  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0335342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0809  argininosuccinate lyase  57.92 
 
 
490 aa  509  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6164  argininosuccinate lyase  58.01 
 
 
477 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2834  argininosuccinate lyase  61.97 
 
 
495 aa  502  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6457  argininosuccinate lyase  57.79 
 
 
477 aa  502  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0675  argininosuccinate lyase  53.19 
 
 
505 aa  499  1e-140  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1985  argininosuccinate lyase  55.67 
 
 
480 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290932  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3523  argininosuccinate lyase  59.18 
 
 
470 aa  498  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10100  argininosuccinate lyase  58.48 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3307  argininosuccinate lyase  59.61 
 
 
470 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11677  argininosuccinate lyase  59.47 
 
 
470 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480026  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2980  argininosuccinate lyase  58.73 
 
 
470 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0620413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2965  argininosuccinate lyase  58.52 
 
 
470 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4987  argininosuccinate lyase  51.08 
 
 
488 aa  472  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3009  argininosuccinate lyase  58.52 
 
 
470 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.658773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2418  argininosuccinate lyase  48.25 
 
 
461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4737  argininosuccinate lyase  46.39 
 
 
462 aa  442  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0435199  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0498  argininosuccinate lyase  46.39 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0178  argininosuccinate lyase  46.05 
 
 
458 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4459  argininosuccinate lyase  47.05 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0185476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1229  argininosuccinate lyase  51.79 
 
 
459 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4527  argininosuccinate lyase  46.17 
 
 
462 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4879  argininosuccinate lyase  46.17 
 
 
462 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0038  argininosuccinate lyase  49.78 
 
 
468 aa  438  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1344  argininosuccinate lyase  45.98 
 
 
459 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00256621  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2702  argininosuccinate lyase  47.47 
 
 
459 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4763  argininosuccinate lyase  46.61 
 
 
463 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00012697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4764  argininosuccinate lyase  46.17 
 
 
462 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4363  argininosuccinate lyase  46.39 
 
 
463 aa  433  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4374  argininosuccinate lyase  46.17 
 
 
462 aa  434  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.24188  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0761  argininosuccinate lyase  48.35 
 
 
481 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1827  argininosuccinate lyase  49.11 
 
 
462 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.986813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0209  argininosuccinate lyase  45.8 
 
 
458 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000346068 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0278  argininosuccinate lyase  47.23 
 
 
460 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4747  argininosuccinate lyase  45.95 
 
 
462 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2269  argininosuccinate lyase  43.08 
 
 
461 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3145  argininosuccinate lyase  45.59 
 
 
458 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339392  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1169  argininosuccinate lyase  48.02 
 
 
462 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0156  argininosuccinate lyase  46.22 
 
 
458 aa  425  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1248  argininosuccinate lyase  50.23 
 
 
465 aa  427  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3641  argininosuccinate lyase  46.26 
 
 
458 aa  427  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3305  argininosuccinate lyase  45.51 
 
 
462 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167787  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3660  argininosuccinate lyase  47.06 
 
 
462 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1123  argininosuccinate lyase ArgH-like protein  43.52 
 
 
458 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.168929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0231  argininosuccinate lyase  46.58 
 
 
458 aa  427  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3714  argininosuccinate lyase  47.06 
 
 
462 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.564837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0979  argininosuccinate lyase  53.2 
 
 
505 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3168  argininosuccinate lyase  46.39 
 
 
458 aa  425  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2022  argininosuccinate lyase  47.12 
 
 
469 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61578  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1807  argininosuccinate lyase  47.47 
 
 
461 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2284  argininosuccinate lyase  48.37 
 
 
464 aa  422  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0400918 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1248  argininosuccinate lyase  42.92 
 
 
462 aa  424  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000860987  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2889  argininosuccinate lyase  46.72 
 
 
462 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.438761 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0033  argininosuccinate lyase  50.23 
 
 
467 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0497  argininosuccinate lyase  47.61 
 
 
476 aa  420  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47620  argininosuccinate lyase  48.45 
 
 
464 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0740  argininosuccinate lyase  46.02 
 
 
463 aa  419  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.121768  normal  0.29697 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0572  argininosuccinate lyase  45.9 
 
 
456 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3748  argininosuccinate lyase  45.59 
 
 
458 aa  420  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0490  argininosuccinate lyase  48.86 
 
 
469 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1701  argininosuccinate lyase  47.14 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0732  argininosuccinate lyase  44.05 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0166776  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0125  argininosuccinate lyase  48.43 
 
 
464 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0796  argininosuccinate lyase  47.18 
 
 
461 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2151  argininosuccinate lyase  50 
 
 
475 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000172098  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0841  argininosuccinate lyase  46.37 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.330511  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0501  argininosuccinate lyase  48.46 
 
 
467 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0277  argininosuccinate lyase  47.39 
 
 
464 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3110  argininosuccinate lyase  49 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0345  argininosuccinate lyase  49.1 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0060  argininosuccinate lyase  45.8 
 
 
466 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.58938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>