More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0102 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 520 aa  1066    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  51.15 
 
 		 518 aa  557  1e-157  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  47.7 
 
 		 511 aa  483  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 509 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.3 
 
 		 526 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.58 
 
 		 525 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.77 
 
 		 525 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.39 
 
 		 526 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  45.9 
 
 		 523 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.82 
 
 		 525 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.3 
 
 		 525 aa  451  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.68 
 
 		 519 aa  448  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.88 
 
 		 530 aa  448  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.02 
 
 		 526 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  47.58 
 
 		 522 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.8 
 
 		 525 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.32 
 
 		 527 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  46.55 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  45.35 
 
 		 541 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  43.16 
 
 		 520 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  43.13 
 
 		 516 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 		 515 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  42.26 
 
 		 521 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 		 518 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  42.2 
 
 		 514 aa  363  3e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 		 518 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  40.46 
 
 		 518 aa  360  5e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 518 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  37.72 
 
 		 520 aa  357  2.9999999999999997e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 		 518 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 515 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  42.07 
 
 		 515 aa  356  5.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 		 524 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 518 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 526 aa  349  6e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 506 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  39.45 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  41.62 
 
 		 503 aa  339  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 519 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 509 aa  322  7e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 508 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  40.13 
 
 		 502 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  39.33 
 
 		 517 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 520 aa  320  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  38.06 
 
 		 503 aa  320  6e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 517 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 530 aa  319  9e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 		 525 aa  318  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  38.67 
 
 		 518 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 		 518 aa  316  5e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 531 aa  316  6e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.85 
 
 		 556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.85 
 
 		 556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.85 
 
 		 556 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.62 
 
 		 579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  39.46 
 
 		 1043 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 499 aa  312  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 525 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  39.65 
 
 		 508 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  38.49 
 
 		 529 aa  309  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0588  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 		 515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.204195  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 527 aa  308  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  38.62 
 
 		 530 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 502 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  37.09 
 
 		 556 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 517 aa  306  6e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  37.76 
 
 		 520 aa  306  7e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 508 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  37.07 
 
 		 532 aa  303  5.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  38.54 
 
 		 537 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  38.54 
 
 		 537 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  38.54 
 
 		 537 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.55 
 
 		 570 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.6 
 
 		 514 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 534 aa  302  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.42 
 
 		 529 aa  302  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  38.85 
 
 		 536 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  36.86 
 
 		 516 aa  299  7e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  36.79 
 
 		 504 aa  299  9e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  38.1 
 
 		 529 aa  299  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 540 aa  299  1e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 530 aa  299  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.866447  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 		 530 aa  299  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 501 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 535 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 511 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  38.4 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  37.03 
 
 		 531 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  36.12 
 
 		 529 aa  297  3e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  38.45 
 
 		 516 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.09 
 
 		 519 aa  296  4e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 512 aa  297  4e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>