210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0358 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0358  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  33.58 
 
 		 254 aa  152  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.08 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2023  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.58 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0047774  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.71 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.7 
 
 		 267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.2 
 
 		 265 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.57 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1684  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.21 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.94 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.72 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.921977  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2766  motility protein A  29.1 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000892451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.05 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2706  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.89 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.44 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.08 
 
 		 250 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.06 
 
 		 299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.97 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.81 
 
 		 251 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.23 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  29.79 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.21 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  29.7 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.8 
 
 		 272 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27650  flagellar motor protein  32.46 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0653  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.41 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000451505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  28.41 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.74 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.51 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  28.32 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2871  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.3 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.63 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.2 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.63 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3836  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.2 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0179071 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.3 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.26 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31120  flagellar motor component  28.79 
 
 		 253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.229766  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2933  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.14 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3475  flagellar motor protein PomA  29.26 
 
 		 255 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113278  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  29.26 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1314  flagellar motor protein  30.47 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.939173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.46 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.46 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1250  flagellar motor protein  31.8 
 
 		 245 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.910285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  29.15 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.2 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1794  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.24 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.97 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  28.2 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.2 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2981  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.46 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.44999 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1586  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.1 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0614  flagellar motor protein MotA  27.51 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01428  flagellar motor protein PomA  28.89 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.68 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  29.43 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  28.89 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  30.27 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  28.52 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  30.65 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.79 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.48 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2433  flagellar motor protein PomA  28.68 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0744  flagellar motor protein  30.08 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  30.23 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.24 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.15 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.2 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0987  flagellar motor protein MotA  26.67 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2988  flagellar motor protein PomA  27.92 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.924494  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.24 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45560  flagellar motor protein  30 
 
 		 246 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.687243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.22 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  27.72 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3866  flagellar motor protein  30.53 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0355  flagellar motor protein MotA  25.46 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1745  flagellar motor protein  28.52 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0461  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.69 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.8 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  28.79 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.37 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.87 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  31.66 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1745  flagellar motor protein  28.52 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  31.74 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4599  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.04 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.666334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.87 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3326  flagellar motor protein PomA  26.79 
 
 		 255 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.582531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.82 
 
 		 261 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  28.95 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  31.03 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0968  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.36 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.71 
 
 		 262 aa  99.4  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  29.37 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  30.65 
 
 		 246 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>