More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1586 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1586  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.63 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.314329  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1684  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.57 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1402  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.18 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.462015  normal  0.61336 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3589  chemotaxis protein MotA  31.75 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0049  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.39 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2425  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000186684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2319  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.213848  hitchhiker  0.00117076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1945  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.1 
 
 		 250 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0118211  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0314  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.98 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.450284  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.92 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.822271 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16780  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.28 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000859777  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.07 
 
 		 255 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.572139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1717  chemotaxis protein PomA  31.64 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.690132  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2017  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.2 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0578  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.4 
 
 		 261 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1172  proton conductor component of motor; no effect on switching  29.34 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1538  chemotaxis protein MotA  32.55 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1299  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.13 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.458392  normal  0.442571 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1505  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.41 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.85 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.921977  normal  0.338656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2078  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.52 
 
 		 257 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.174751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3364  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.53 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0112135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2100  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.77 
 
 		 257 aa  111  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1535  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.74 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0781  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.66 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00147223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3219  flagellar motor protein PomA  32.14 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.5 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.362877  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0287  chemotaxis protein MotA (Motility protein A)  28.91 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1012  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.68 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1269  chemotaxis protein PomA  31.72 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.942425  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0771  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.22 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1984  chemotaxis motA protein  28.92 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.258638  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.82 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4830  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5297  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1397  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.73 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9942  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2472  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.49 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3432  flagellar motor protein  28.92 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.228788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2568  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.82 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.3 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.894352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0691  permease  30.7 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3510  putative chemotaxis protein MotA (flagellar motor component)  31.33 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.932647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.98 
 
 		 265 aa  105  8e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0358  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.1 
 
 		 275 aa  105  9e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0820  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.08 
 
 		 251 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27650  flagellar motor protein  31.13 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133269  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1072  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.69 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.57 
 
 		 288 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.351337  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1385  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.09 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0233  flagellar motor protein MotA  31.03 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.961919  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1875  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0131395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1495  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.86 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00626739  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5375  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.17 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.486184 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1539  flagellar motor protein MotP  30 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1658  flagellar motor protein MotP  30 
 
 		 254 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2911  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.3 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000718069  normal  0.214195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2023  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.63 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0047774  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1295  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.23 
 
 		 262 aa  102  8e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3905  flagellar motor protein  28.11 
 
 		 246 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.448269  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1504  flagellar motor protein MotP  29.02 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.886706  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.86 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4336  flagellar motor protein  27.71 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0869231  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.2 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0425767  normal  0.0158705 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0833  flagellar motor protein PomA  32.14 
 
 		 256 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1568  flagellar motor protein  29.2 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.709398  normal  0.407351 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1394  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.48 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.592217 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1970  flagellar motor protein  27.64 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004255  Flagellar motor rotation protein MotA  29.06 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.762495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0253  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.46 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0255  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.46 
 
 		 262 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1531  flagellar motor protein  27.71 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.270936  normal  0.422767 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1544  flagellar motor protein MotP  28.63 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1015  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.57 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.459149  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2800  flagellar motor protein  28.4 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.76835  normal  0.157366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3662  flagellar motor protein  27.71 
 
 		 246 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1515  flagellar motor protein MotP  28.79 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1725  flagellar motor protein MotP  28.79 
 
 		 277 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1746  flagellar motor protein MotP  28.63 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1803  flagellar motor protein MotP  28.63 
 
 		 277 aa  99  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1340  flagellar motor protein MotP  29.02 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1693  flagellar motor protein MotP  31.56 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3653  flagellar motor protein MotP  31.56 
 
 		 277 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01176  flagellar motor protein PomA  28.3 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1343  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.52 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.428194  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2787  flagellar motor protein PomA  29.22 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.315605  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0541  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.99 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1529  flagellar motor protein PomA  29.63 
 
 		 255 aa  96.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4079  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.32 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.05 
 
 		 277 aa  95.9  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0031  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.24 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1858  flagellar motor protein  26.61 
 
 		 246 aa  96.3  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.403238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0936  flagellar motor protein PomA  27.48 
 
 		 254 aa  95.9  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0279323  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.18 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.263961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1092  flagellar motor protein PomA  28.79 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.51 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000377193  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.03 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0447441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1322  flagellar motor protein PomA  28.12 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1278  flagellar motor protein PomA  27.85 
 
 		 255 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.398192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>