More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1637 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 625 aa  1225    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  44.03 
 
 		 673 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  44.36 
 
 		 636 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  43.05 
 
 		 675 aa  412  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  38.43 
 
 		 677 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  39.49 
 
 		 680 aa  363  4e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  39.68 
 
 		 691 aa  359  9e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  38.53 
 
 		 698 aa  340  5e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  40.27 
 
 		 626 aa  318  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  35.14 
 
 		 709 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2674  N-6 DNA methylase  35.68 
 
 		 746 aa  299  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559823  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  36.61 
 
 		 558 aa  252  1e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  27.95 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  27.02 
 
 		 501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  28.99 
 
 		 548 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  28.3 
 
 		 525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.35 
 
 		 538 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  28.3 
 
 		 525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  29.6 
 
 		 569 aa  135  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  29.79 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  28.13 
 
 		 511 aa  134  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2509  site-specific DNA-methyltransferase  28.29 
 
 		 540 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.642426 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  29.33 
 
 		 498 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  30.39 
 
 		 521 aa  131  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3080  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.12 
 
 		 549 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.801077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0034  N-6 DNA methylase  28.07 
 
 		 544 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12769  type I restriction/modification system DNA methylase hsdM  28.9 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  24.6 
 
 		 510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  26.93 
 
 		 519 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  27.51 
 
 		 500 aa  127  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  28.96 
 
 		 532 aa  127  7e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  28.88 
 
 		 568 aa  126  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  27.09 
 
 		 540 aa  127  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3915  N-6 DNA methylase  29.91 
 
 		 541 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  27.84 
 
 		 544 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  30.1 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.36 
 
 		 503 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  28.88 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  29.33 
 
 		 570 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3767  N-6 DNA methylase  27.22 
 
 		 564 aa  124  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  26.33 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4777  N-6 DNA methylase  27.02 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  28.94 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  28.99 
 
 		 527 aa  121  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  27.11 
 
 		 518 aa  120  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  28.42 
 
 		 514 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  26.5 
 
 		 576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  27.7 
 
 		 527 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  29.54 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  27.1 
 
 		 517 aa  118  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  27.5 
 
 		 520 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  25.34 
 
 		 540 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  26.93 
 
 		 528 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1940  N-6 DNA methylase  25.98 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0625168  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  29.9 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  31.19 
 
 		 849 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  31.72 
 
 		 504 aa  113  9e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  30.57 
 
 		 499 aa  113  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0877  putative type I restriction-modification system, M subunit  26.1 
 
 		 529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3300  N-6 DNA methylase  28.3 
 
 		 537 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500405 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1359  N-6 DNA methylase  25.38 
 
 		 529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.315285 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  23.82 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4931  type I restriction-modification system, M subunit  24.78 
 
 		 539 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.748503  normal  0.593383 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  28.39 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  30.53 
 
 		 633 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  33.6 
 
 		 498 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  30.34 
 
 		 799 aa  104  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03120  type I restriction system adenine methylase HsdM  29.07 
 
 		 856 aa  105  4e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0118515  hitchhiker  7.147270000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1959  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  28.4 
 
 		 855 aa  104  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  25.16 
 
 		 508 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  26.75 
 
 		 809 aa  104  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  26.98 
 
 		 775 aa  104  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4240  N-6 DNA methylase  25.24 
 
 		 567 aa  103  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.386659  hitchhiker  0.00142847 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  28.53 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  31.41 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  28.53 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  28.75 
 
 		 810 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  28.52 
 
 		 547 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  27.83 
 
 		 587 aa  102  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  32.31 
 
 		 500 aa  100  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4473  N-6 DNA methylase  24.69 
 
 		 567 aa  100  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.844286 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01115  type I restriction-modification system, methyltransferase subunit  29.34 
 
 		 862 aa  100  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  27.67 
 
 		 814 aa  99.8  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  30.13 
 
 		 505 aa  99.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.74 
 
 		 526 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1915  type I restriction-modification system, M subunit  29.8 
 
 		 853 aa  99  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.93858  hitchhiker  0.00587021 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  26.33 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  27.97 
 
 		 810 aa  98.6  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1843  type I restriction-modification system, M subunit  25.74 
 
 		 554 aa  98.6  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  27.91 
 
 		 501 aa  98.6  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  28.1 
 
 		 518 aa  98.2  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4082  type I restriction-modification system, M subunit  27.53 
 
 		 863 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  29.44 
 
 		 847 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  32.17 
 
 		 498 aa  98.2  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  26.32 
 
 		 535 aa  97.8  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  27.17 
 
 		 499 aa  97.8  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  28.71 
 
 		 574 aa  97.4  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3536  type I restriction-modification system, M subunit  27.74 
 
 		 863 aa  97.4  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3672  type I restriction-modification system, M subunit  28.06 
 
 		 910 aa  97.1  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4162  type I restriction-modification system, M subunit  29.53 
 
 		 874 aa  97.1  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.235487 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>