More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2139 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2139  putative lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase protein  100 
 
 		 364 aa  719    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  49.29 
 
 		 355 aa  332  9e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  39.6 
 
 		 351 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 		 358 aa  182  6e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  36.18 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  31.71 
 
 		 343 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0264  phosphatidylserine decarboxylase  37.25 
 
 		 341 aa  143  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.290494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  33.54 
 
 		 387 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  31.19 
 
 		 350 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.77 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  32.89 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.12 
 
 		 366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.26 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  34.87 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0356  glycosyl transferase group 1  35.36 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  34.73 
 
 		 380 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 		 353 aa  107  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 380 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 		 364 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  33.55 
 
 		 390 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  34.67 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 384 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  38.76 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 371 aa  103  7e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 398 aa  102  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  35.87 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  34.47 
 
 		 376 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 369 aa  99.4  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  33.94 
 
 		 376 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2639  glycosyl transferase, group 1  34.56 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0389  glycosyl transferase group 1  31.43 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  37.61 
 
 		 389 aa  96.7  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2976  glycosyl transferase group 1  42.2 
 
 		 417 aa  96.3  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  31.54 
 
 		 387 aa  95.9  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.3 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  29.3 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  29.3 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  29.3 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.3 
 
 		 381 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 		 376 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  33.47 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.3 
 
 		 381 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  36.79 
 
 		 378 aa  93.6  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  37.5 
 
 		 407 aa  92.8  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 		 381 aa  92.8  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 		 381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  24.01 
 
 		 341 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.13 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2884  glycosyl transferase group 1  41.95 
 
 		 417 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  40.24 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2765  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117052  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3258  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  34.45 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  33.97 
 
 		 378 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2949  glycosyl transferase group 1  32.79 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0244554  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.84 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  33.64 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1126  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 360 aa  90.5  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 360 aa  90.1  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  29.01 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 		 371 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2857  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 379 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  34.51 
 
 		 383 aa  89.4  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  26.99 
 
 		 366 aa  89  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  35.71 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 377 aa  89  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  31.39 
 
 		 413 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  34.01 
 
 		 395 aa  89  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  24.72 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  34.08 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 378 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.99 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  32.73 
 
 		 378 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  36.09 
 
 		 379 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44790  Glycosyl transferase, group 1  38.5 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  45.45 
 
 		 377 aa  87.4  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0763  glycosyl transferase, group 1  35.71 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0143067 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  35.88 
 
 		 398 aa  87.4  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0496  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0195  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 370 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.76 
 
 		 419 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  25.6 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  35.93 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1193  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 371 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  23.64 
 
 		 342 aa  86.7  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>