91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0745 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  721    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  61.52 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35570  hypothetical protein  62.69 
 
 		 333 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000834616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1939  DNA topoisomerase  58.18 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.915147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2998  hypothetical protein  62.65 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3831  DNA topoisomerase  58.48 
 
 		 340 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3546  DNA topoisomerase  58.48 
 
 		 340 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3200  DNA topoisomerase  56.89 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2976  DNA topoisomerase, type I, putative  56.46 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0896688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2759  DNA topoisomerase I  56.05 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2775  DNA topoisomerase  57.01 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430877  normal  0.381387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3748  DNA topoisomerase  59.31 
 
 		 363 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3425  DNA topoisomerase  61.04 
 
 		 392 aa  381  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1162  putative DNA topoisomerase, type I  54.52 
 
 		 420 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4373  hypothetical protein  57.49 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372426  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5444  DNA topoisomerase  55.49 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.585007 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5923  DNA topoisomerase  56.35 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5297  DNA topoisomerase  54.52 
 
 		 411 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.696955  normal  0.0424045 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5631  DNA topoisomerase, type I, putative  55.46 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.646844  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5996  DNA topoisomerase, type I, putative  55.46 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963911  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6192  DNA topoisomerase, type I, putative  56.66 
 
 		 358 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6487  DNA topoisomerase  55.76 
 
 		 342 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5964  DNA topoisomerase  55.66 
 
 		 359 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0366811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0757  putative DNA topoisomerase I  52.6 
 
 		 404 aa  346  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1929  putative DNA topoisomerase I  54.52 
 
 		 401 aa  342  8e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0245783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2251  putative DNA topoisomerase I  54.55 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5045  putative DNA topoisomerase I  52.11 
 
 		 389 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5352  putative DNA topoisomerase I  50.7 
 
 		 396 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1974  putative DNA topoisomerase I  54.22 
 
 		 400 aa  339  4e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3998  putative DNA topoisomerase I  48.24 
 
 		 363 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1732  DNA topoisomerase  49.57 
 
 		 366 aa  326  5e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754109 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5285  putative DNA topoisomerase I  50.15 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313661  normal  0.942542 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1140  putative DNA topoisomerase I  49.29 
 
 		 382 aa  322  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2773  hypothetical protein  47.08 
 
 		 397 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0558  DNA topoisomerase, type I, putative  50.16 
 
 		 370 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1492  putative DNA topoisomerase, type I  50.74 
 
 		 406 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236582  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1320  putative DNA topoisomerase, type I  47.26 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3640  DNA topoisomerase, type I, putative  51.13 
 
 		 336 aa  309  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169892  normal  0.477069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3231  DNA topoisomerase  44.88 
 
 		 365 aa  295  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03321  DNA topoisomerase  50 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4313  hypothetical protein  48.54 
 
 		 370 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0039  hypothetical protein  46.55 
 
 		 361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2291  DNA topoisomerase IB  41.42 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0533881  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0837  DNA topoisomerase, type I, putative  42.36 
 
 		 375 aa  281  2e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0995  DNA topoisomerase  43.24 
 
 		 353 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0066  hypothetical protein  50.61 
 
 		 352 aa  277  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0864  topoisomerase IB-like protein  40.67 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.990941  hitchhiker  0.00000103848 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7273  DNA topoisomerase  44.94 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4343  putative DNA topoisomerase, type I  43.29 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.466096  normal  0.0120507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1222  DNA topoisomerase  40.88 
 
 		 349 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3186  DNA topoisomerase, type I, putative  42.06 
 
 		 366 aa  261  8.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2594  hypothetical protein  44.83 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5876  putative DNA topoisomerase I protein  41.95 
 
 		 334 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4410  putative DNA topoisomerase I protein  42.26 
 
 		 372 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017671  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6784  putative DNA topoisomerase I protein  41.52 
 
 		 335 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09733  putative DNA topoisomerase I  37.62 
 
 		 361 aa  235  8e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3368  topoisomerase IB-like protein  37.67 
 
 		 360 aa  235  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0946  putative DNA topoisomerase I protein  42.99 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2968  topoisomerase IB-like protein  42.73 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2605  putative DNA topoisomerase I protein  42.69 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6633  hypothetical protein  40.86 
 
 		 337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2058  type I topoisomerase, putative  41.51 
 
 		 349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3430  DNA topoisomerase  41.61 
 
 		 342 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1709  type I topoisomerase  40.99 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1645  putative topoisomerase IB  41.07 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0910813  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1753  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  41.26 
 
 		 338 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1279  hypothetical protein  39.73 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1296  hypothetical protein  39.73 
 
 		 339 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2853  hypothetical protein  33.65 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.866388  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0278  putative DNA topoisomerase I protein  38.97 
 
 		 323 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1308  hypothetical protein  39.73 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5208  type I topoisomerase  36.42 
 
 		 333 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1767  hypothetical protein  40.71 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0728  hypothetical protein  39.56 
 
 		 334 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01676  DNA topoisomerase  35.59 
 
 		 340 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1967  hypothetical protein  38.14 
 
 		 340 aa  192  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0761805  normal  0.132479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4748  hypothetical protein  38.23 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0334  hypothetical protein  38.1 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  0.045652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4790  DNA topoisomerase IB  40.46 
 
 		 316 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3146  type I topoisomerase  41.75 
 
 		 381 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.139598  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3091  hypothetical protein  35 
 
 		 336 aa  182  8.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3038  type I topoisomerase  41.75 
 
 		 377 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4311  DNA topoisomerase  38.75 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2791  hypothetical protein  37.8 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0179136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24670  topoisomerase IB  36.84 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112949  normal  0.189574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2946  topoisomerase IB-like protein  40.13 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.0194958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2951  type I topoisomerase  41.7 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1096  putative viral-like DNA topoisomerase  39.4 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1357  putative viral-like DNA topoisomerase  38.8 
 
 		 330 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.180216  hitchhiker  0.0000165561 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  25.15 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>